RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C ATG16Q03818 150 aa2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C CAC2Q04199 468 aa2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C VMS1Q04311 632 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C EIS1Q05050 843 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C PIG1Q06216 648 aa2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C THI3Q07471 609 aa2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C ADE3P07245 946 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C MIS1P09440 975 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C MSM1P22438 575 aa2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C RIT1P23796 513 aa2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C PWP2P25635 923 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C DBF20P32328 564 aa2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C OCT1P35999 772 aa2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C VPS24P36095 224 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C BUD16P39988 312 aa2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C PCL6P40038 420 aa2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C IES5P40060 125 aa2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C CAB2P40506 365 aa2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YPT11P48559 417 aa2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C GTB1Q04924 702 aa2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C ICL2Q12031 575 aa2.09□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C BIK1P11709 440 aa2.08□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C PTH2P34222 208 aa2.08□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C FUI1P38196 639 aa2.08□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C PUG1P40100 303 aa2.08□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C AAT1Q01802 451 aa2.08□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C GSH2Q08220 491 aa2.08□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C ILV2P07342 687 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C CLB4P24871 460 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C LAC1P28496 418 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C MRS6P32864 603 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YBR138CP38277 524 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C ERR3P42222 437 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C ATG21Q02887 496 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C CIA1Q05583 330 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C PCT1P13259 424 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C NCP1P16603 691 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C ARP2P32381 391 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C RTT107P38850 1070 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C MET30P39014 640 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YND1P40009 630 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C FAF1P40546 346 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C MSY1P48527 492 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YGR021WP53212 290 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C BLS1Q06071 122 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C PDR8Q06149 701 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C GRS2Q06817 618 aa2.07□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C COX1P00401 534 aa2.06□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C TRX2P22803 104 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C SWC3P31376 625 aa2.06□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C SIP1P32578 815 aa2.06□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C LEU5P38702 357 aa2.06□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C SAP185P40856 1058 aa2.06□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C IMA1P53051 589 aa2.06□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YGR079WP53249 370 aa2.06□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C ARC35P53731 342 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C SCW10Q04951 389 aa2.06□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C ARP9Q05123 467 aa2.06□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C MCH4Q08268 501 aa2.06□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C SUL2Q12325 893 aa2.06□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C PHO2P07269 559 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C NUC1P08466 329 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C PET122P10355 254 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C CDC23P16522 626 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YCL049CP25577 312 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C URK1P27515 501 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C GEX2P36173 615 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C SCO2P38072 301 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C EFM2P38347 419 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C FSH1P38777 243 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C PSF2P40359 213 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YIL169CP40442 995 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YNL144CP53907 740 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C BET4Q00618 327 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C MRPL13Q02204 264 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C TRS130Q03660 1102 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C SWF1Q04629 336 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YLR281CQ05863 155 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C PSR2Q07949 397 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C NRT1Q08485 598 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C BAG7Q12128 409 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C MSS51P32335 436 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C GCD7P32502 381 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C MNN2P38069 597 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C EXO84P38261 753 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C TAM41P53230 385 aa2.05□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C GPA1P08539 472 aa2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C MTF2P10849 440 aa2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C UBC1P21734 215 aaKnown RBP2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C YSP3P25036 478 aa2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C MRPL36P36531 177 aa2.04□□□□□ -2.08
HDA3YPR179C SMK1P41808 388 aa2.04□□□□□ -2.08
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