RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	YGR066C	P53242	292 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	FHN1	P53279	174 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	TMA10	Q06177	86 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	RIM20	Q12033	661 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	MLH3	Q12083	715 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
CMR3	YPR013C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	STE11	P23561	717 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	ADK2	P26364	225 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	CDC5	P32562	705 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	ELM1	P32801	640 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	CCL1	P37366	393 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	SMF1	P38925	575 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YEL057C	P39983	233 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	MET28	P40573	187 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	DIP5	P53388	608 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	SPC98	P53540	846 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	CIK1	Q01649	594 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YEH1	Q07804	573 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CMR3	YPR013C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	CLB3	P24870	427 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	YKL100C	P34248	587 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	APL3	P38065	1025 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	VID24	P38263	362 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	RIM8	P53179	542 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	YGR079W	P53249	370 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	YGR151C	P53287	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	JJJ1	P53863	590 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	YML119W	Q03208	357 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	UFO1	Q04511	668 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	IRC3	Q06683	689 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	TGS1	Q12052	315 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	USV1	Q12132	391 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	SPE4	Q12455	300 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	ERG4	P25340	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	GPI10	P30777	616 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	LOT5	P34234	306 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	AGP2	P38090	596 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	LTP1	P40347	161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	SSU1	P41930	458 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	YIP4	P53093	235 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	LCL3	P53153	274 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	BUD17	P53727	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	INA17	Q02888	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	YML037C	Q03703	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	PSR1	Q07800	427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	ESC8	Q08119	714 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	BAG7	Q12128	409 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	YPT6	Q99260	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	STE50	P25344	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	YIH1	P25637	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	CNE1	P27825	502 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	SIP1	P32578	815 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	MDL1	P33310	695 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	GCS1	P35197	352 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	RXT2	P38255	430 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	DOT5	P40553	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	BUL1	P48524	976 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	MSE1	P48525	536 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	SGF73	P53165	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	BTN2	P53286	410 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	SNF12	P53628	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	RIA1	P53893	1110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	RKI1	Q12189	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	TRM13	Q12383	476 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	REC107	P21651	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CMR3	YPR013C	MNE1	P24720	663 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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