RNA–Protein interactions for RNA: YOR249C

APC5, Transcript of Subunit of the Anaphase-Promoting Complex/Cyclosome (APC/C), yeast

Gene APC5, Length 2,058 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APC5	YOR249C	SPO22	P40511	975 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	RSC1	P53236	928 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	CRT10	Q08226	957 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.49	□□□□□ -1.85	not detected
APC5	YOR249C	NMD4	Q12129	218 aa		3.49	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	COX1	P00401	534 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	AAC1	P04710	309 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	HOM3	P10869	527 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	KAR3	P17119	729 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	BLI1	P35727	113 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	GLG1	P36143	616 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	MAL33	P38157	468 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	YHL017W	P38745	532 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	MAM1	P40065	302 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	DJP1	P40564	432 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	KIN4	Q01919	800 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	YML053C	Q04978	212 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	YDL242W	Q07746	117 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	TCO89	Q08921	799 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	YBR085C-A	O43137	85 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	POL4	P25615	582 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	CDC15	P27636	974 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	MTH1	P35198	433 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	BYE1	P36106	594 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	ERC1	P38767	581 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	UBX6	P47049	396 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	NPA3	P47122	385 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	SKG3	Q06315	1026 aa		3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	CBS1	P14066	229 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	OCA4	P25366	362 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	GDA1	P32621	518 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	NPL6	P32832	435 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	LCL3	P53153	274 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	MUK1	Q02866	612 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	CRN1	Q06440	651 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	ROX1	P25042	368 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	ERG3	P32353	365 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	PXA2	P34230	853 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	YKL050C	P35736	922 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	SRO77	P38163	1010 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	LAS21	P40367	830 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	GLO1	P50107	326 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	COG2	P53271	262 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	COQ6	P53318	479 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	YMR155W	Q03795	547 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	YDR109C	Q04585	715 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	GRC3	Q07845	632 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	SFI1	Q12369	946 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	ZPS1	Q12512	249 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
APC5	YOR249C	WHI2	P12611	486 aa		3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	HES1	P35843	434 aa		3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	REG2	P38232	338 aa		3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	BDH2	P39713	417 aa		3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	MIT1	P40002	666 aa		3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	YAT1	P80235	687 aa		3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	YML037C	Q03703	340 aa		3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	SWA2	Q06677	668 aa		3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	BAG7	Q12128	409 aa		3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	LCB4	Q12246	624 aa		3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	RTN2	Q12443	393 aa		3.46	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	YSP3	P25036	478 aa		3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	RPC53	P25441	422 aa		3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	LAC1	P28496	418 aa		3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	MRPL9	P31334	269 aa		3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	TRM2	P33753	639 aa		3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	UBP13	P38187	747 aa		3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	RGI2	P40188	164 aa		3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	AXL1	P40851	1208 aa		3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	MSE1	P48525	536 aa		3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	MSY1	P48527	492 aa		3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	AAT1	Q01802	451 aa		3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	PCL8	Q08966	492 aa		3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
APC5	YOR249C	YMC2	P38087	329 aa		3.45	□□□□□ -1.86

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