RNA–Protein interactions for RNA: YOL007C

CSI2, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene CSI2, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2YOL007C AIM6Q07716 390 aa3.41□□□□□ -1.86
CSI2YOL007C YFL068WP0CX99 160 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YLL066W-AP0CY00 160 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YLL067W-AP0CY01 160 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C CNA1P23287 553 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C SWC3P31376 625 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YOX1P34161 385 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C FMP46P36141 133 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C SDS24P38314 527 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C STB5P38699 743 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C FSH1P38777 243 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C MAM1P40065 302 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C PUG1P40100 303 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C HOS2P53096 452 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C MRPL13Q02204 264 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C RRI1Q12468 440 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YMR230W-AQ3E7B5 62 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C SSM4P40318 1319 aa3.4□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C MTF2P10849 440 aa3.39□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C RIT1P23796 513 aa3.39□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C CLB4P24871 460 aa3.39□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YCL049CP25577 312 aa3.39□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YCR061WP25639 631 aa3.39□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C PSY4P38193 441 aa3.39□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C IML2P47031 731 aa3.39□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YML053CQ04978 212 aa3.39□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C RTT103Q05543 409 aa3.39□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C ADE3P07245 946 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C NUC1P08466 329 aa3.38□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C RPS7AP26786 190 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C PRE2P30656 287 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C SMK1P41808 388 aa3.38□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C DIG1Q03063 452 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C TRS130Q03660 1102 aa3.38□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C KGD2P19262 463 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C UBC1P21734 215 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C SSH4P32343 579 aa3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C EXO84P38261 753 aa3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C DED81P38707 554 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C ARB1P40024 610 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C PSF2P40359 213 aa3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YJL107CP42947 387 aa3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C ARC35P53731 342 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C ESF2P53743 316 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YML131WQ03102 365 aa3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C OPY2Q06810 360 aa3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C GSH2Q08220 491 aa3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YBR255C-AQ3E776 120 aa3.37□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C PET122P10355 254 aa3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C NCP1P16603 691 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C PDE1P22434 369 aa3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C SWI4P25302 1093 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C PPZ1P26570 692 aa3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C ARP2P32381 391 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C GCD7P32502 381 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YBR138CP38277 524 aa3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C ARO9P38840 513 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C LNP1P38878 278 aa3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data3.36□□□□□ -1.87not detected
CSI2YOL007C KAP123P40069 1113 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C VRG4P40107 337 aa3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C ERR3P42222 437 aa3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C SAD1P43589 448 aa3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YNL144CP53907 740 aa3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C CSR1Q06705 408 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YDL242WQ07746 117 aa3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C ICL2Q12031 575 aa3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C NKP1Q12493 238 aa3.36□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C SES1P07284 462 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data3.35□□□□□ -1.87not detected
CSI2YOL007C RAD16P31244 790 aa3.35□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C UME6P39001 836 aa3.35□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C SKP2P42843 763 aa3.35□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C CTF18P49956 741 aa3.35□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C GTR1Q00582 310 aa3.35□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C BET4Q00618 327 aa3.35□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C CRF1Q04930 467 aa3.35□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C ATG23Q06671 453 aa3.35□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C SUL2Q12325 893 aa3.35□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YER175W-AQ8TGU4 54 aa3.35□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C RER1P25560 188 aa3.34□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C NUP120P35729 1037 aa3.34□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C RRN3P36070 627 aa3.34□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C YND1P40009 630 aa3.34□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C UBP7P40453 1071 aa3.34□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C ORC5P50874 479 aa3.34□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C GTB1Q04924 702 aa3.34□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C TFC6Q06339 672 aa3.34□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C SSP2Q08646 371 aa3.34□□□□□ -1.87
CSI2YOL007C GSH1P32477 678 aa3.33□□□□□ -1.88
CSI2YOL007C SLC1P33333 303 aa3.33□□□□□ -1.88
CSI2YOL007C RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
CSI2YOL007C YAT1P80235 687 aa3.33□□□□□ -1.88
CSI2YOL007C MTG1Q03151 367 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CSI2YOL007C YDL121CQ07541 149 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.8 ms