RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	VHS3	Q08438	674 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	CYT1	P07143	309 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	CDC42	P19073	191 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YSP3	P25036	478 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	CKB2	P38930	258 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YGR021W	P53212	290 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	BUD7	Q08754	746 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YLL056C	Q12177	298 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	DCW1	P36091	449 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	ASG7	P46993	209 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	NHP10	Q03435	203 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	CIA1	Q05583	330 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	RGT2	Q12300	763 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	NTO1	Q12311	748 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	PDR1	P12383	1068 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	BUD14	P27637	709 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	MTG2	P38860	518 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	ATG3	P40344	310 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	ALG8	P40351	577 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	TAH11	P47112	604 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	HLJ1	P48353	224 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	HST3	P53687	447 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	SPO20	Q04359	397 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	SOV1	Q04748	898 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	CRN1	Q06440	651 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	ALR1	Q08269	859 aa		3.19	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	TRA1	P38811	3744 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	GAL11	P19659	1081 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	RSC6	P25632	483 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	ELM1	P32801	640 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	SQT1	P35184	431 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	SAF1	P38352	637 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YHL008C	P38750	627 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	BRO1	P48582	844 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	SCY1	P53009	804 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	PRM1	P53835	661 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YPL014W	Q02606	381 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YPL113C	Q02961	396 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	ATG16	Q03818	150 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	BOP2	Q06150	570 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	SKM1	Q12469	655 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	SPO12	P17123	173 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	HEM3	P28789	327 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	FLC2	P39719	783 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	ATM1	P40416	690 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	ELP2	P42935	788 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	COG6	P53959	839 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	PET117	Q02771	107 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	CDA1	Q06702	301 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YLR001C	Q07895	862 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YLR462W	O13556	202 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	SEC63	P14906	663 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	MGT1	P26188	188 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	SFC1	P33303	322 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	POP4	P38336	279 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YHL049C	P38722	271 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	VFA1	P40080	203 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YIR007W	P40566	764 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	FIG4	P42837	879 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YFL064C	P43540	174 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	RMD8	P43620	662 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	KAP114	P53067	1004 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
STE6	YKL209C	PIR1	Q03178	341 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	THI7	Q05998	598 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	PIN2	Q12057	282 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.18	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	ATP4	P05626	244 aa		3.17	□□□□□ -1.9
STE6	YKL209C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9

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