RNA–Protein interactions for RNA: YJR130C

STR2, Transcript of Cystathionine gamma-synthase, converts cysteine into cystathionine, yeast

Gene STR2, Length 1,920 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STR2	YJR130C	MAM1	P40065	302 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	MET18	P40469	1032 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	STB1	P42845	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	RIA1	P53893	1110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	TIM10	P87108	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	FDC1	Q03034	503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	YML108W	Q03759	105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	DUS4	Q06063	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	NKP2	Q06162	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	THI22	Q06490	572 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	YDL073W	Q07454	984 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STR2	YJR130C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	EHT1	P38295	451 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	ECL1	P48235	211 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	FMS1	P50264	508 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YGL242C	P53066	181 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	SHE10	P53075	577 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	MRPS35	P53292	345 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	MEH1	Q02205	184 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	GCN5	Q03330	439 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	MED7	Q08278	222 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	CDC25	P04821	1589 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YLR302C	O13544	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	ACP1	P32463	125 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	COY1	P34237	679 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YKL050C	P35736	922 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	COS111	P38308	924 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.83	□□□□□ -1.64	not detected
STR2	YJR130C	YJR061W	P40355	935 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YIL077C	P40508	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YIL001W	P40560	513 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	MTL1	P53214	551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	FCP1	Q03254	732 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TAF11	Q04226	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	FUS2	Q05670	677 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	ICL2	Q12031	575 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	PCD1	Q12524	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	RAV1	P47104	1357 aa		4.83	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	HIS3	P06633	220 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	PET122	P10355	254 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	TYR1	P20049	452 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	RPO26	P20435	155 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	MBR1	P23493	339 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	KAR4	P25583	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	DCG1	P32460	244 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	MUM2	P38236	366 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YSW1	P38280	609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	LYS9	P38999	446 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	FKH2	P41813	862 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YJR079W	P47126	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	COG1	P53079	417 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	ARR2	Q06597	130 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YFT2	Q06676	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	AIM6	Q07716	390 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	GRC3	Q07845	632 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	LYS2	P07702	1392 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	SWI1	P09547	1314 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	SGF29	P25554	259 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	YKR073C	P36153	106 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	APD1	P38281	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	HSM3	P38348	480 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	STB5	P38699	743 aa		4.82	□□□□□ -1.64
STR2	YJR130C	PLB1	P39105	664 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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