RNA–Protein interactions for RNA: YJL172W

CPS1, Transcript of Vacuolar carboxypeptidase S, yeast

Gene CPS1, Length 1,731 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPS1	YJL172W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	TAF10	Q12030	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SRN2	Q99176	213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	FRT1	Q99332	602 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	STF1	P01098	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	PHO8	P11491	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	CLN2	P20438	545 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	GDA1	P32621	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SDS22	P36047	338 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	APM3	P38153	483 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	MSG5	P38590	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YTA12	P40341	825 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	EFM4	P40516	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	PKP1	P40530	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	GNP1	P48813	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SCS3	P53012	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	MTO1	P53070	669 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	RMI1	Q02685	241 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	ROD1	Q02805	837 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	NSE5	Q03718	556 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	RSM24	Q03976	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	VIK1	Q12045	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SCM3	Q12334	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SIR3	P06701	978 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	PUT4	P15380	627 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	KIN82	P25341	720 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	HSP30	P25619	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	MSS51	P32335	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YSC83	P32792	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	MRP4	P32902	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	MRX3	P38172	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	FES1	P38260	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	CCZ1	P38273	704 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	COS111	P38308	924 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YMR262W	P38430	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SAW1	P39735	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YIL077C	P40508	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	TED1	P40533	473 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	TOS3	P43637	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	POL31	P46957	487 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	COS5	P47187	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	NIT3	P49954	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	RTT102	P53330	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	ERG5	P54781	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	NGL3	Q03210	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	PPM1	Q04081	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	PHO92	Q06390	306 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YPD1	Q07688	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	OSW1	Q08692	278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	TCO89	Q08921	799 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	AHC1	Q12433	566 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	TMA17	Q12513	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	TRP3	P00937	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	KIN3	P22209	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SIN4	P32259	974 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	BCS1	P32839	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SDH8	P38345	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	HXT7	P39004	570 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	RTS2	P40962	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	STB2	P46679	850 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	MAD3	P47074	515 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	ROM1	P53046	1155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SPC105	P53148	917 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	ARK1	P53974	638 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	UBX4	P54730	416 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	RSC4	Q02206	625 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	HFD1	Q04458	532 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SPR28	Q04921	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	SGO1	Q08490	590 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	IES4	Q08561	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	RSA1	Q08932	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CPS1	YJL172W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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