RNA–Protein interactions for RNA: YHR065C

RRP3, Transcript of Protein involved in rRNA processing, yeast

Gene RRP3, Length 1,506 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP3	YHR065C	YFL052W	P43551	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ATG36	P46983	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	URB2	P47108	1174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RTA1	P53047	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PCL10	P53124	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	HRD3	Q05787	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	AAD4	Q07747	329 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	IMA2	Q08295	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	HRT3	Q12347	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	UBR2	Q07963	1872 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RNQ1	P25367	405 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MGT1	P26188	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	DSS4	P32601	143 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	CKB2	P38930	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	VPS41	P38959	992 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	JHD1	P40034	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SCC4	P40090	624 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RSM26	P47141	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YPR003C	P53394	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	KTR6	P54070	446 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	VPS9	P54787	451 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	USA1	Q03714	838 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SSY1	Q03770	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	GRX8	Q05926	109 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	GPM3	Q12326	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	KAR4	P25583	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YCR051W	P25631	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RAD27	P26793	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SET3	P36124	751 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	FUI1	P38196	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	LAM1	P38851	1228 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YJL132W	P47014	750 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ALY2	P47029	1046 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MRX6	P48564	524 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	BET4	Q00618	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	DAL4	Q04895	635 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ARP7	Q12406	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
RRP3	YHR065C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	TSR4	P25040	408 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YIH1	P25637	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SQT1	P35184	431 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	BIT2	P38346	545 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	HSE1	P38753	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SPC97	P38863	823 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RAD26	P40352	1085 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RRT5	P43607	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	TRS85	P46944	698 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	IML2	P47031	731 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ZIP2	P53061	704 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MET13	P53128	600 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PEX13	P80667	386 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MRS2	Q01926	470 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	TPP1	Q03796	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PIG1	Q06216	648 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	AAD15	Q08361	143 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	NRT1	Q08485	598 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SVS1	Q12254	260 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	NCA2	Q12374	616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PRC1	P00729	532 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	MAS1	P10507	462 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PGS1	P25578	521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PRO1	P32264	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	PEX2	P32800	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	GCS1	P35197	352 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YKR051W	P36142	418 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YBR056W	P38081	501 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	ECM13	P38195	257 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	YBR225W	P38321	900 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RIM4	P38741	713 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	REV7	P38927	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	STL1	P39932	569 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RRP3	YHR065C	RTT101	P47050	842 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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