RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	MDG1	P53885	366 aa		4.49	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	SMA2	Q04658	369 aa		4.49	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	ESBP6	P53918	673 aa		4.48	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	VPS64	Q03944	604 aa		4.48	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	PEX15	Q08215	383 aa		4.48	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	YML002W	P0CF17	737 aa		4.47	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	YCR006C	P25350	157 aa		4.47	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	MRC1	P25588	1096 aa		4.47	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	UBP12	P39538	1254 aa		4.47	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	UBX6	P47049	396 aa		4.47	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	YNL034W	P53963	612 aa		4.47	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	YDL121C	Q07541	149 aa		4.47	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.46	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	CRD1	Q07560	283 aa		4.46	□□□□□ -1.69
NEM1	YHR004C	HNM1	P19807	563 aa		4.46	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	RAD24	P32641	659 aa		4.46	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	ERP2	P39704	215 aa		4.46	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	YEN1	P40028	759 aa		4.46	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	YNL181W	P53878	407 aa		4.46	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	TRE2	Q08693	809 aa		4.46	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	FRE3	Q08905	711 aa		4.46	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	CBP1	P07252	654 aa		4.45	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	HES1	P35843	434 aa		4.45	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	EFM2	P38347	419 aa		4.45	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	CYB2	P00175	591 aa		4.44	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	COX1	P00401	534 aa		4.44	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	YLF2	P38746	405 aa		4.44	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	IML2	P47031	731 aa		4.44	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	AIM6	Q07716	390 aa		4.44	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	RSA1	Q08932	381 aa		4.44	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	PMS1	P14242	873 aa		4.43	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	TGL1	P34163	548 aa		4.43	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	ATG27	P46989	271 aa		4.43	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	SDS22	P36047	338 aa		4.42	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	PAF1	P38351	445 aa		4.42	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	NKP1	Q12493	238 aa		4.42	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	FOL1	P53848	824 aa		4.41	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.41	□□□□□ -1.7
NEM1	YHR004C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	PHO3	P24031	467 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	YNL234W	P53857	426 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	COG4	Q06096	861 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	SLX4	Q12098	748 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.4	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	GPA1	P08539	472 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	CPR3	P25719	182 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	AAD4	Q07747	329 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	NYV1	Q12255	253 aa		4.39	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	RPN12	P32496	274 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	TRS65	P32893	560 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	ATG16	Q03818	150 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	ATP4	P05626	244 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	MSH1	P25846	959 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	SAW1	P39735	261 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	PHM8	P40025	321 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	YJR061W	P40355	935 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	YGR021W	P53212	290 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	PEX8	P53248	589 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	YGR079W	P53249	370 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	MGR1	P25573	417 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	TOA1	P32773	286 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	YPK3	P38070	525 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	FUI1	P38196	639 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	RIM2	P38127	377 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	EXO84	P38261	753 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	GTB1	Q04924	702 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	MCP2	Q06567	569 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	NUR1	Q12066	484 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	BAR1	P12630	587 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NEM1	YHR004C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71

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