RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A NPA3P47122 385 aa2.93□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A MGR1P25573 417 aa2.92□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A RPN2P32565 945 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A MRPL4P36517 319 aa2.92□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A YHR218WP38899 603 aa2.92□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A ARB1P40024 610 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A SPC105P53148 917 aa2.92□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A SMA1Q02651 245 aa2.92□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A DAP1Q12091 152 aa2.92□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A TMA17Q12513 150 aa2.92□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A BAR1P12630 587 aa2.91□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A YBR071WP38243 211 aa2.91□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A YNL181WP53878 407 aa2.91□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A TLG2Q08144 397 aa2.91□□□□□ -1.94
YHL009W-AYHL009W-A CBS2P14905 389 aa2.9□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A LAC1P28496 418 aa2.9□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A GRX4P32642 244 aa2.9□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A RIM2P38127 377 aa2.9□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A YEL068CP39977 110 aa2.9□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A MKT1P40850 830 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A YNL234WP53857 426 aa2.9□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A COG6P53959 839 aa2.9□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A TRS31Q03337 283 aa2.9□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A GUK1P15454 187 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A PDE1P22434 369 aa2.89□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A MSH1P25846 959 aa2.89□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A BUD14P27637 709 aa2.89□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A AVT5P38176 459 aa2.89□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A SSP120P39931 234 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A STL1P39932 569 aa2.89□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A YJR061WP40355 935 aa2.89□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A YRB30P53107 440 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A SLD3P53135 668 aa2.89□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A BSC6Q08280 497 aa2.89□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A COX1P00401 534 aa2.88□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A TFC4P33339 1025 aa2.88□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A PPT2Q12036 173 aa2.88□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A DBP10Q12389 995 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A GPA1P08539 472 aa2.87□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A RPS7AP26786 190 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A UBX6P47049 396 aa2.87□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A UTP21Q06078 939 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A TRE2Q08693 809 aa2.87□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A YBR255C-AQ3E776 120 aa2.87□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A YER145C-AA0A023PYF4 145 aa2.86□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A LDB16P25587 256 aa2.86□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A SWH1P35845 1188 aa2.86□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A LEU5P38702 357 aa2.86□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A FUN12P39730 1002 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A SCS2P40075 244 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A POL31P46957 487 aa2.86□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A YGL081WP53156 320 aa2.86□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A PEX15Q08215 383 aa2.86□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A BSC1Q12140 328 aa2.86□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A SUI3P09064 285 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A LSB5P25369 354 aa2.85□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A PDR3P33200 976 aa2.85□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A YPK3P38070 525 aa2.85□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A RRT2P38332 387 aa2.85□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A HOL1P53389 586 aa2.85□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A YNL034WP53963 612 aa2.85□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A DOS2P54858 310 aa2.85□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A TRI1Q05024 226 aa2.85□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A ADH4P10127 382 aa2.84□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A MRP2P10663 115 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A HES1P35843 434 aa2.84□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A IMA5P40884 581 aa2.84□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A YDR109CQ04585 715 aa2.84□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A SLX4Q12098 748 aa2.84□□□□□ -1.95
YHL009W-AYHL009W-A TGL1P34163 548 aa2.83□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A NUR1Q12066 484 aa2.83□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A YLR049CQ12110 428 aa2.83□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A PGI1P12709 554 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A EMP65P40085 556 aa2.82□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A YIR014WP40570 242 aa2.82□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A VPS64Q03944 604 aa2.82□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A RSF1Q05043 376 aa2.82□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A PHM6Q05637 104 aa2.82□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A PSR2Q07949 397 aa2.82□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A ICL2Q12031 575 aa2.82□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A CSR2Q12734 1121 aa2.82□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A VAS1P07806 1104 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A KAR1P11927 433 aa2.81□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A PHO3P24031 467 aa2.81□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A SPG5P42933 373 aa2.81□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A PUS4P48567 403 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A BOR1P53838 576 aa2.81□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A FOL1P53848 824 aa2.81□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A YLR455WQ06188 304 aa2.81□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A MCP2Q06567 569 aa2.81□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A PSF3Q12146 194 aa2.81□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A PEX14P53112 341 aa2.8□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A YGR079WP53249 370 aa2.8□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A ESF2P53743 316 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A AIM6Q07716 390 aa2.8□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A GLN3P18494 730 aa2.79□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A SWD1P39706 426 aa2.79□□□□□ -1.96
YHL009W-AYHL009W-A IAH1P41734 238 aa2.79□□□□□ -1.96
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