RNA–Protein interactions for RNA: YFL039C

ACT1, Transcript of Actin, yeast

Gene ACT1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACT1	YFL039C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	MRK1	P50873	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	SPC98	P53540	846 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	TIM10	P87108	93 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	ARR3	Q06598	404 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	ISA2	Q12425	185 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	POL3	P15436	1097 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
ACT1	YFL039C	HOP1	P20050	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	MNE1	P24720	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	ADY2	P25613	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	MSH1	P25846	959 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	CBF2	P32504	956 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	SLC1	P33333	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	SWH1	P35845	1188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	EHT1	P38295	451 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	EAF5	P39995	279 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	SKP2	P42843	763 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	MNT2	P53059	558 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	RMT2	Q03305	412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	PHO92	Q06390	306 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	NFI1	Q12216	726 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ACT1	YFL039C	CTT1	P06115	562 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	CKA1	P15790	372 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	CBP3	P21560	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	SMI1	P32566	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	PPE1	P38796	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YEL025C	P39991	1188 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	UBP7	P40453	1071 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
ACT1	YFL039C	ZIM17	P42844	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	RMD8	P43620	662 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YJL055W	P47044	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	PNG1	Q02890	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MGR3	Q04472	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MCP2	Q06567	569 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MDM36	Q06820	579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	TPK2	P06245	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	VPS33	P20795	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	VPS17	P32913	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	STL1	P39932	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	PAC2	P39937	518 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YEL068C	P39977	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	BUD16	P39988	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	SMK1	P41808	388 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	THI6	P41835	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	VID30	P53076	958 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	GIM3	P53900	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	EOS1	P53938	366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YDR131C	Q03899	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	GGA1	Q06336	557 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	SKS1	Q12505	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	BNR1	P40450	1375 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	SPO11	P23179	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	ERG3	P32353	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	SPC110	P32380	944 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	LOT5	P34234	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MTG2	P38860	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YJL193W	P39542	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YJL070C	P40361	888 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	IMA5	P40884	581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MAD2	P40958	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	EPL1	P43572	832 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	VPS4	P52917	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YIP4	P53093	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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