RNA–Protein interactions for RNA: YER117W

RPL23B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L23B, yeast

Gene RPL23B, Length 414 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL23B	YER117W	GEX2	P36173	615 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	YBP1	P38315	674 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	PCA1	P38360	1216 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	YHR078W	P38799	552 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	PIK1	P39104	1066 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	ERP2	P39704	215 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	YJR061W	P40355	935 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	ATM1	P40416	690 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	EFM4	P40516	257 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	ALY2	P47029	1046 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	TCB2	P48231	1178 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	MRX6	P48564	524 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	AIM14	P53109	570 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	COG7	P53195	279 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.97	□□□□□ -1.93	not detected
RPL23B	YER117W	ALF1	P53904	254 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	AQR1	P53943	586 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	CTR9	P89105	1077 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	PIR1	Q03178	341 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	NGL3	Q03210	505 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	INP2	Q03824	705 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	GRX8	Q05926	109 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	THI7	Q05998	598 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	NUT2	Q06213	157 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	SWC7	Q06707	132 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	OPI10	Q08202	246 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	AAD15	Q08361	143 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	PGC1	Q08959	321 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	PER33	Q12144	273 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	GPM3	Q12326	303 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	SPO21	Q12411	609 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	PEX11	Q12462	236 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	UBR1	P19812	1950 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RPL23B	YER117W	IRA2	P19158	3079 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	SAC7	P17121	654 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	SFL1	P20134	766 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	CKI1	P20485	582 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	MRPL8	P22353	238 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	RBK1	P25332	333 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	YCR015C	P25616	317 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	KAR9	P32526	644 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	RML2	P32611	393 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	SRX1	P36077	127 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	TFA2	P36145	328 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	APM3	P38153	483 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	FUI1	P38196	639 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	RCK2	P38623	610 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	YHL008C	P38750	627 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	PPE1	P38796	400 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	AIM18	P38884	321 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	RAD26	P40352	1085 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	ARG2	P40360	574 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	PAN6	P40459	309 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.96	□□□□□ -1.94	not detected
RPL23B	YER117W	RFX1	P48743	811 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	COQ5	P49017	307 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	NUP84	P52891	726 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	MNT2	P53059	558 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	BTN2	P53286	410 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	YTP1	P53584	459 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	PRM1	P53835	661 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	VAC7	P53950	1165 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	YMR187C	Q03236	431 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	MSH6	Q03834	1242 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	YPR114W	Q06107	315 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	VAC14	Q06708	880 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	SOG2	Q08817	791 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	APL5	Q08951	932 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	YLL056C	Q12177	298 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	YDR018C	Q12185	396 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	SFI1	Q12369	946 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	ZRT2	Q12436	422 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RPL23B	YER117W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		2.96	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 90.1 ms