RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	PET127	P32606	800 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	CTM1	P38818	585 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	HLJ1	P48353	224 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	MPS1	P54199	764 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	YML119W	Q03208	357 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	INP2	Q03824	705 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	VTI1	Q04338	217 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	YPS7	Q06325	596 aa		4.77	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	RIM15	P43565	1770 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	CLB4	P24871	460 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	RAD16	P31244	790 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	NTH1	P32356	751 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	YKU70	P32807	602 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	YEN1	P40028	759 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	VFA1	P40080	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.76	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	KIN82	P25341	720 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	YUR1	P26725	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	BUD14	P27637	709 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	YIL001W	P40560	513 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	YGR237C	P50089	785 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	CPR8	P53728	308 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	MFM1	Q02783	413 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	TRS23	Q03784	219 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	FAR8	Q05040	523 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.75	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	MYO1	P08964	1928 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	YCR051W	P25631	222 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	TFC3	P34111	1160 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	OAF3	P36023	863 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	PIH1	P38768	344 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
POP4	YBR257W	AXL1	P40851	1208 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	BUD8	P41698	603 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	MET13	P53128	600 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	YNL193W	P53870	558 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	STP1	Q00947	519 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	UME1	Q03010	460 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	ARO80	Q04052	950 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	SPC24	Q04477	213 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	SOV1	Q04748	898 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	TAF10	Q12030	206 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	SLM3	Q12093	417 aa		4.74	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	PSO2	P30620	661 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	TOM20	P35180	183 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	GRX7	P38068	203 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
POP4	YBR257W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	GRX3	Q03835	250 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	VPS64	Q03944	604 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	URH1	Q04179	340 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	TAF9	Q05027	157 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	NDL1	Q06568	189 aa		4.73	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	JIP3	O13555	125 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	TUP1	P16649	713 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	PMA2	P19657	947 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	IES1	P43579	692 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	BTN2	P53286	410 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	GTR1	Q00582	310 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	BET4	Q00618	327 aa		4.72	□□□□□ -1.65
POP4	YBR257W	UBP16	Q02863	499 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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