RNA–Protein interactions for RNA: YAL063C

FLO9, Transcript of Lectin-like protein with similarity to Flo1p, yeast

Gene FLO9, Length 3,969 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FLO9	YAL063C	SSY1	Q03770	852 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	SWF1	Q04629	336 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	PUS9	Q12069	462 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	NTO1	Q12311	748 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	ARG3	P05150	338 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	PHO13	P19881	312 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	YCR051W	P25631	222 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	AST1	P35183	429 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	TAF14	P35189	244 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	NEM1	P38757	446 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	GLG2	P47011	380 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	GTO1	P48239	356 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	MUK1	Q02866	612 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	CAB1	Q04430	367 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	MHR1	Q06630	226 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	YPR084W	Q06821	456 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	SEM1	O94742	89 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	HMG2	P12684	1045 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	CLN2	P20438	545 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	TFC1	P32367	649 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	PRP40	P33203	583 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	STB6	P36085	766 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	CDS1	P38221	457 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RIM4	P38741	713 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	PRM9	P39551	298 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	NDE1	P40215	560 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	IRC24	P40580	263 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	TAF6	P53040	516 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	HDA1	P53973	706 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	EAR1	Q03212	550 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RAX1	Q08760	435 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	MTF2	P10849	440 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	CHS2	P14180	963 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	PRD1	P25375	712 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	LYP1	P32487	611 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	OAF3	P36023	863 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	YKL133C	P36066	463 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	SUR2	P38992	349 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	FYV10	P40492	516 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	GTT1	P40582	234 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RPE1	P46969	238 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	CCC1	P47818	322 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	MSE1	P48525	536 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RMR1	P53060	241 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	ORC3	P54790	616 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	VTA1	Q06263	330 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	PHO92	Q06390	306 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	ATG20	Q07528	640 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	BDS1	Q08347	646 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	DIN7	Q12086	430 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	CDC23	P16522	626 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	SPS22	P25380	463 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	PRR1	P28708	518 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	GSH1	P32477	678 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	TRM5	P38793	499 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	SMF1	P38925	575 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	YER130C	P39959	443 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	GID8	P40208	455 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	YFR018C	P43599	363 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RPC17	P47076	161 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	HXT17	P53631	564 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	YPR196W	Q06595	470 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	FEX1	Q08913	375 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	APM4	Q99186	491 aa		3.36	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	RAD24	P32641	659 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	VPS17	P32913	551 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	ELF1	P36053	145 aa		3.35	□□□□□ -1.87
FLO9	YAL063C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87

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