RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617806.4

BECN1-222, Transcript of beclin 1, human

TSL 5

Gene BECN1, Length 4,865 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BECN1-222	ENST00000617806	PICALM	Q13492	652 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	ZMYM6	O95789	1325 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	USP27X	A6NNY8	438 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	ASIC2	Q16515	512 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	DAAM2	Q86T65	1068 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	PLA2R1	Q13018	1463 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	EXOC4	Q96A65	974 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	RNF40	O75150	1001 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	RPS6KA1	Q15418	735 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	PROSER3	Q2NL68	480 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	VWA3B	Q502W6	1294 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	FAM13A	O94988	1023 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	RBL2	Q08999	1139 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	KCTD16	Q68DU8	428 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	IFT74	Q96LB3	600 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	PGBD1	Q96JS3	809 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806		F8W031	263 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	ATP2A1	O14983	1001 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	SARM1	Q6SZW1	724 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	CEP63	Q96MT8	703 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.41
BECN1-222	ENST00000617806	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ATP11A	P98196	1134 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PLS1	Q14651	629 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	VSTM4	Q8IW00	320 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	TSKS	Q9UJT2	592 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	CEP83	Q9Y592	693 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PPP2R5B	Q15173	497 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	LRRC24	Q50LG9	513 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	BICD1	Q96G01	975 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	NLRP3	Q96P20	1036 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	BUB1	O43683	1085 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ADAMTS2	O95450	1211 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PCK1	P35558	622 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ATP6V1A	P38606	617 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	CETN3	O15182	167 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	DNM2	P50570	870 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	COPRS	Q9NQ92	184 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC160	A6NGH7	325 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PPP6R2	O75170	966 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	NEBL	O76041	1014 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	CABP7	Q86V35	215 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SPATA5	Q8NB90	893 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	TRIM7	Q9C029	511 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SPOP	O43791	374 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PPFIA4	O75335	1185 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	FANCB	Q8NB91	859 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	STIM2	Q9P246	746 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	FAM170A	A1A519	330 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	STAMBP	O95630	424 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	IL2RB	P14784	551 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	PTPRO	Q16827	1216 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	LPIN2	Q92539	896 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	SMC6	Q96SB8	1091 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BECN1-222	ENST00000617806	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		12.44	□□□□□ -0.42

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