RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 CDC27P30260 824 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 TRAPPC10P48553 1259 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 ST5P78524 1137 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 NT5DC1Q5TFE4 455 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CEP135Q66GS9 1140 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 MSL1Q68DK7 614 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 MICU3Q86XE3 530 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CNBD1Q8NA66 436 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CNNM3Q8NE01 707 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 KIF12Q96FN5 646 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 ARMT1Q9H993 441 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SPON1Q9HCB6 807 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 KIF13BQ9NQT8 1826 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 NEDD4P46934 1319 aa9.76□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 C10orf71Q711Q0 1435 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 KIF28PB7ZC32 967 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 ORC4O43929 436 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 TIE1P35590 1138 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 FOSBP53539 338 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SBK1Q52WX2 424 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 TPTE2Q6XPS3 522 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 ZNF654Q8IZM8 581 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 ANKRD7Q92527 254 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 NRBP1Q9UHY1 535 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CHD4Q14839 1912 aa9.75□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 TRIM75PA6NK02 468 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 ZSCAN12O43309 604 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 DTNBO60941 627 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SERPINB2P05120 415 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 TM4SF1P30408 202 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 GNAQP50148 359 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 BCAMP50895 628 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 TUBB4BP68371 445 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 FANCCQ00597 558 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 DDR1Q08345 913 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SEC23AQ15436 765 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SHC4Q6S5L8 630 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 NBPF11Q86T75 865 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SMARCE1Q969G3 411 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 TOMM22Q9NS69 142 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 RAI14Q9P0K7 980 aa9.74□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 DLEC1Q9Y238 1755 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SERPINC1P01008 464 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 TPM1P09493 284 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CALML3P27482 149 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 KIF5BP33176 963 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 KRT2P35908 639 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 SARSP49591 514 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 UBASH3AP57075 661 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CCZ1BP86790 482 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 RBM10P98175 930 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 PDE4BQ07343 736 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 NCAPHQ15003 741 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 GALNT17Q6IS24 598 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 LCORLQ8N3X6 602 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 MPNDQ8N594 471 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 PHKBQ93100 1093 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 NLRP3Q96P20 1036 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 ZNF287Q9HBT7 754 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 IFNKQ9P0W0 207 aa9.73□□□□□ -0.85
ACTB-208ENST00000464611 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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