RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PRG0 241 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 ERC2O15083 957 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 MAP3K13O43283 966 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 GPAA1O43292 621 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 TLR2O60603 784 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-DOAP06340 250 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 AKR1B1P15121 316 aa8.44□□□□□ -1.06
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RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.44□□□□□ -1.06
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RABGEF1-206ENST00000461017 FAM227BQ96M60 508 aa8.44□□□□□ -1.06
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RABGEF1-206ENST00000461017 FSD1Q9BTV5 496 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
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RABGEF1-206ENST00000461017 INCENPQ9NQS7 918 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.43□□□□□ -1.06
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RABGEF1-206ENST00000461017 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
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RABGEF1-206ENST00000461017 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.42□□□□□ -1.06
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RABGEF1-206ENST00000461017 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa8.42□□□□□ -1.06
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
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RABGEF1-206ENST00000461017 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 SDSP20132 328 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 RASA1P20936 1047 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 TIE1P35590 1138 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.4□□□□□ -1.06
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RABGEF1-206ENST00000461017 ERO1AQ96HE7 468 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 EFCC1Q9HA90 598 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 AS3MTQ9HBK9 375 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-206ENST00000461017 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.4□□□□□ -1.06
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RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf81C9J6K1 198 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-206ENST00000461017 PRDM1O75626 825 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-206ENST00000461017 CNMDO75829 334 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-206ENST00000461017 APPP05067 770 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-206ENST00000461017 OSBPP22059 807 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-206ENST00000461017 PSMC4P43686 418 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-206ENST00000461017 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.39□□□□□ -1.07
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