RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 LrmpQ60664 539 aa15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BccipQ9CWI3 316 aa15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Myo1hQ9D6A1 958 aa15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nek3Q9R0A5 511 aa15.56■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Phrf1A6H619 1682 aa15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Psd3Q2PFD7 1037 aa15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fxr1Q61584 677 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vps53Q8CCB4 832 aa15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf568E9PYI1 671 aa15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 LtbrP50284 415 aa15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mad2l2Q9D752 211 aa15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Jag1Q9QXX0 1218 aa15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Col11a2Q64739 1736 aa15.55■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MarcksP26645 309 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sdc2P43407 202 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rad23bP54728 416 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znf667Q2TL60 609 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rc3h1Q4VGL6 1130 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hexim1Q8R409 356 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zmym2Q9CU65 1376 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Frat1P70339 274 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ppp4cP97470 307 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Scg2Q03517 617 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 DSCC1Q14AI0 399 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mdh1bQ5F204 500 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Krt39Q6IFX4 482 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pde5aQ8CG03 865 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Chd5A2A8L1 1946 aa15.54■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ugt1a6bK9J7B2 531 aa15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pla2g4bP0C871 782 aa15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Il7P10168 154 aa15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Myo19Q5SV80 963 aa15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ugt1a6Q64435 531 aa15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ugt1a7cQ6ZQM8 531 aa15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Bend4P86174 541 aa15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdc37Q61081 379 aa15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dnm3Q8BZ98 863 aa15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Clip2Q9Z0H8 1047 aa15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa15.53■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 A0A0U1RNP2 1173 aa15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem60Q8K174 133 aa15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 HibadhQ99L13 335 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lmbr1Q9JIT0 490 aa15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cep135Q6P5D4 1140 aa15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Asnsd1Q8BFS9 627 aa15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankk1Q8BZ25 745 aa15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Washc1Q8VDD8 475 aa15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trmt44Q9D2Q2 713 aa15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cbx6Q9DBY5 414 aa15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 AllcQ9JHX6 414 aa15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ubxn8Q9QZ49 277 aa15.52■□□□□ 0.08
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Myh7bA2AQP0 1941 aa15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cyp26c1B2RXA7 518 aa15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PnnO35691 725 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Atp6v0a2P15920 856 aa15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 MsnP26041 577 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdh15P33146 784 aa15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nek1P51954 1203 aa15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 1810065E05RikQ5NC41 235 aa15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 St5Q924W7 1134 aa15.52■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Card6E9PWH2 1175 aa15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sun3Q5SS91 320 aa15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mxd3Q80US8 206 aa15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hps4Q99KG7 671 aa15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem47Q9JJG6 181 aa15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Api5O35841 504 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 PsdQ5DTT2 1024 aa15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sass6Q80UK7 654 aa15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mei4Q8BRM6 389 aa15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Klhl30Q8C3F7 581 aa15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cd2apQ9JLQ0 637 aa15.51■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nfil3O08750 462 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 DnttP09838 530 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dok7Q18PE0 504 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 VrtnQ3SYK4 740 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Panx2Q6IMP4 677 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dusp9Q7TNL7 452 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Frmd3Q8BHD4 595 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mtmr6Q8VE11 617 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gdf11Q9Z1W4 405 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21969J3QJZ1 289 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Surf1P09925 306 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc9a1Q61165 820 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankrd13aQ80UP5 588 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Kctd3Q8BFX3 815 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Enox1Q8BHR2 643 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cep128Q8BI22 1102 aa15.5■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cyp2j7A0A140T8U1 504 aa15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Armc2Q3URY6 854 aa15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Caps2Q8BUG5 550 aa15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 OplahQ8K010 1288 aa15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cdk8Q8R3L8 464 aa15.49■□□□□ 0.07
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Scrn1Q9CZC8 414 aa15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.9 ms