Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
Lmbr1Q9JIT0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
Lmbr1Q9JIT0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Lmbr1Q9JIT0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Lmbr1Q9JIT0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Lmbr1Q9JIT0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Lmbr1Q9JIT0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Lmbr1Q9JIT0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Lmbr1Q9JIT0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Lmbr1Q9JIT0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Lmbr1Q9JIT0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Lmbr1Q9JIT0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Lmbr1Q9JIT0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Lmbr1Q9JIT0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Lmbr1Q9JIT0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Lmbr1Q9JIT0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Lmbr1Q9JIT0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Lmbr1Q9JIT0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lmbr1Q9JIT0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Lmbr1Q9JIT0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Lmbr1Q9JIT0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lmbr1Q9JIT0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Lmbr1Q9JIT0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lmbr1Q9JIT0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lmbr1Q9JIT0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lmbr1Q9JIT0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Lmbr1Q9JIT0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Lmbr1Q9JIT0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmbr1Q9JIT0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Lmbr1Q9JIT0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Lmbr1Q9JIT0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Lmbr1Q9JIT0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Lmbr1Q9JIT0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Lmbr1Q9JIT0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Lmbr1Q9JIT0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Lmbr1Q9JIT0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Lmbr1Q9JIT0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lmbr1Q9JIT0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Lmbr1Q9JIT0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Lmbr1Q9JIT0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Lmbr1Q9JIT0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Lmbr1Q9JIT0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Lmbr1Q9JIT0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
Lmbr1Q9JIT0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Lmbr1Q9JIT0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lmbr1Q9JIT0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Lmbr1Q9JIT0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Lmbr1Q9JIT0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Lmbr1Q9JIT0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Lmbr1Q9JIT0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Lmbr1Q9JIT0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Lmbr1Q9JIT0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Lmbr1Q9JIT0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Lmbr1Q9JIT0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lmbr1Q9JIT0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lmbr1Q9JIT0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lmbr1Q9JIT0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lmbr1Q9JIT0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lmbr1Q9JIT0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lmbr1Q9JIT0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lmbr1Q9JIT0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Lmbr1Q9JIT0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lmbr1Q9JIT0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Lmbr1Q9JIT0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lmbr1Q9JIT0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Lmbr1Q9JIT0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Lmbr1Q9JIT0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Lmbr1Q9JIT0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Lmbr1Q9JIT0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Lmbr1Q9JIT0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmbr1Q9JIT0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lmbr1Q9JIT0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmbr1Q9JIT0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lmbr1Q9JIT0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Lmbr1Q9JIT0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lmbr1Q9JIT0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Lmbr1Q9JIT0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Lmbr1Q9JIT0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Lmbr1Q9JIT0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lmbr1Q9JIT0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lmbr1Q9JIT0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Lmbr1Q9JIT0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Lmbr1Q9JIT0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Lmbr1Q9JIT0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Lmbr1Q9JIT0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Lmbr1Q9JIT0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lmbr1Q9JIT0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Lmbr1Q9JIT0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Lmbr1Q9JIT0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Lmbr1Q9JIT0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lmbr1Q9JIT0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms