Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,37■■■■■ 4,37
Lmbr1Q9JIT0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39,2■■■■□ 3,87
Lmbr1Q9JIT0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,91■■■■□ 3,82
Lmbr1Q9JIT0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,63■■■■□ 3,77
Lmbr1Q9JIT0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Lmbr1Q9JIT0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,66■■■■□ 3,62
Lmbr1Q9JIT0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36,98■■■■□ 3,51
Lmbr1Q9JIT0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,75■■■■□ 3,47
Lmbr1Q9JIT0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,2■■■■□ 3,39
Lmbr1Q9JIT0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Lmbr1Q9JIT0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,16■■■■□ 3,38
Lmbr1Q9JIT0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Lmbr1Q9JIT0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Lmbr1Q9JIT0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Lmbr1Q9JIT0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Lmbr1Q9JIT0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35,4■■■■□ 3,26
Lmbr1Q9JIT0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,36■■■■□ 3,25
Lmbr1Q9JIT0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Lmbr1Q9JIT0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Lmbr1Q9JIT0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Lmbr1Q9JIT0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,15
Lmbr1Q9JIT0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Lmbr1Q9JIT0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,65■■■■□ 3,14
Lmbr1Q9JIT0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Lmbr1Q9JIT0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Lmbr1Q9JIT0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Lmbr1Q9JIT0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34,45■■■■□ 3,11
Lmbr1Q9JIT0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Lmbr1Q9JIT0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,27■■■■□ 3,08
Lmbr1Q9JIT0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,26■■■■□ 3,08
Lmbr1Q9JIT0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,15■■■■□ 3,06
Lmbr1Q9JIT0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Lmbr1Q9JIT0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Lmbr1Q9JIT0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Lmbr1Q9JIT0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,91■■■■□ 3,02
Lmbr1Q9JIT0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Lmbr1Q9JIT0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Lmbr1Q9JIT0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Lmbr1Q9JIT0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Lmbr1Q9JIT0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Lmbr1Q9JIT0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Lmbr1Q9JIT0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Lmbr1Q9JIT0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Lmbr1Q9JIT0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,46■■■□□ 2,95
Lmbr1Q9JIT0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,43■■■□□ 2,94
Lmbr1Q9JIT0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Lmbr1Q9JIT0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Lmbr1Q9JIT0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,33■■■□□ 2,93
Lmbr1Q9JIT0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,3■■■□□ 2,92
Lmbr1Q9JIT0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Lmbr1Q9JIT0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Lmbr1Q9JIT0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Lmbr1Q9JIT0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Lmbr1Q9JIT0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32,96■■■□□ 2,87
Lmbr1Q9JIT0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
Lmbr1Q9JIT0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Lmbr1Q9JIT0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Lmbr1Q9JIT0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Lmbr1Q9JIT0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,6■■■□□ 2,81
Lmbr1Q9JIT0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Lmbr1Q9JIT0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,56■■■□□ 2,8
Lmbr1Q9JIT0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,55■■■□□ 2,8
Lmbr1Q9JIT0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,54■■■□□ 2,8
Lmbr1Q9JIT0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Lmbr1Q9JIT0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,41■■■□□ 2,78
Lmbr1Q9JIT0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Lmbr1Q9JIT0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,4■■■□□ 2,78
Lmbr1Q9JIT0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Lmbr1Q9JIT0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,38■■■□□ 2,77
Lmbr1Q9JIT0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,37■■■□□ 2,77
Lmbr1Q9JIT0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,35■■■□□ 2,77
Lmbr1Q9JIT0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Lmbr1Q9JIT0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Lmbr1Q9JIT0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Lmbr1Q9JIT0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Lmbr1Q9JIT0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC32,06■■■□□ 2,72
Lmbr1Q9JIT0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Lmbr1Q9JIT0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Lmbr1Q9JIT0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,97■■■□□ 2,71
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Lmbr1Q9JIT0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,89■■■□□ 2,7
Lmbr1Q9JIT0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Lmbr1Q9JIT0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Lmbr1Q9JIT0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,87■■■□□ 2,69
Lmbr1Q9JIT0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Lmbr1Q9JIT0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,85■■■□□ 2,69
Lmbr1Q9JIT0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31,84■■■□□ 2,69
Lmbr1Q9JIT0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Lmbr1Q9JIT0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31,75■■■□□ 2,67
Lmbr1Q9JIT0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Lmbr1Q9JIT0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Lmbr1Q9JIT0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Lmbr1Q9JIT0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Lmbr1Q9JIT0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31,58■■■□□ 2,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,9 ms