Protein–RNA interactions for Protein: Q61081

Cdc37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc37Q61081 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
Cdc37Q61081 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cdc37Q61081 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cdc37Q61081 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cdc37Q61081 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Cdc37Q61081 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cdc37Q61081 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Cdc37Q61081 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Cdc37Q61081 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Cdc37Q61081 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Cdc37Q61081 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Cdc37Q61081 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Cdc37Q61081 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Cdc37Q61081 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Cdc37Q61081 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Cdc37Q61081 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cdc37Q61081 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cdc37Q61081 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cdc37Q61081 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Cdc37Q61081 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cdc37Q61081 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cdc37Q61081 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cdc37Q61081 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cdc37Q61081 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdc37Q61081 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cdc37Q61081 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cdc37Q61081 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdc37Q61081 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cdc37Q61081 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cdc37Q61081 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cdc37Q61081 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cdc37Q61081 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cdc37Q61081 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdc37Q61081 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdc37Q61081 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cdc37Q61081 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdc37Q61081 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdc37Q61081 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cdc37Q61081 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cdc37Q61081 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Cdc37Q61081 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cdc37Q61081 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cdc37Q61081 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdc37Q61081 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cdc37Q61081 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
Cdc37Q61081 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cdc37Q61081 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cdc37Q61081 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Cdc37Q61081 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cdc37Q61081 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cdc37Q61081 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdc37Q61081 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Cdc37Q61081 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Cdc37Q61081 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdc37Q61081 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdc37Q61081 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cdc37Q61081 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cdc37Q61081 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cdc37Q61081 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cdc37Q61081 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Cdc37Q61081 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Cdc37Q61081 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cdc37Q61081 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Cdc37Q61081 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cdc37Q61081 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cdc37Q61081 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cdc37Q61081 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Cdc37Q61081 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cdc37Q61081 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cdc37Q61081 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cdc37Q61081 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cdc37Q61081 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cdc37Q61081 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cdc37Q61081 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Cdc37Q61081 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Cdc37Q61081 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cdc37Q61081 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Cdc37Q61081 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Cdc37Q61081 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Cdc37Q61081 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Cdc37Q61081 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Cdc37Q61081 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cdc37Q61081 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Cdc37Q61081 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Cdc37Q61081 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Cdc37Q61081 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cdc37Q61081 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cdc37Q61081 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cdc37Q61081 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cdc37Q61081 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cdc37Q61081 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cdc37Q61081 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cdc37Q61081 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cdc37Q61081 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cdc37Q61081 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Cdc37Q61081 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Cdc37Q61081 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cdc37Q61081 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Cdc37Q61081 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Cdc37Q61081 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms