Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE11

Mtmr6, Myotubularin-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr6Q8VE11 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Mtmr6Q8VE11 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,51■■■■□ 3,6
Mtmr6Q8VE11 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,78■■■■□ 3,48
Mtmr6Q8VE11 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
Mtmr6Q8VE11 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,82■■■■□ 3,32
Mtmr6Q8VE11 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Mtmr6Q8VE11 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Mtmr6Q8VE11 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Mtmr6Q8VE11 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Mtmr6Q8VE11 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Mtmr6Q8VE11 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
Mtmr6Q8VE11 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Mtmr6Q8VE11 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Mtmr6Q8VE11 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Mtmr6Q8VE11 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Mtmr6Q8VE11 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33,82■■■■□ 3
Mtmr6Q8VE11 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,81■■■■□ 3
Mtmr6Q8VE11 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Mtmr6Q8VE11 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Mtmr6Q8VE11 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Mtmr6Q8VE11 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Mtmr6Q8VE11 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,34■■■□□ 2,93
Mtmr6Q8VE11 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Mtmr6Q8VE11 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Mtmr6Q8VE11 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Mtmr6Q8VE11 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Mtmr6Q8VE11 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Mtmr6Q8VE11 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Mtmr6Q8VE11 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,77■■■□□ 2,84
Mtmr6Q8VE11 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Mtmr6Q8VE11 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Mtmr6Q8VE11 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Mtmr6Q8VE11 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Mtmr6Q8VE11 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32,6■■■□□ 2,81
Mtmr6Q8VE11 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Mtmr6Q8VE11 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,52■■■□□ 2,8
Mtmr6Q8VE11 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,29■■■□□ 2,76
Mtmr6Q8VE11 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Mtmr6Q8VE11 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
Mtmr6Q8VE11 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Mtmr6Q8VE11 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Mtmr6Q8VE11 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Mtmr6Q8VE11 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,19■■■□□ 2,74
Mtmr6Q8VE11 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
Mtmr6Q8VE11 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,98■■■□□ 2,71
Mtmr6Q8VE11 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31,96■■■□□ 2,71
Mtmr6Q8VE11 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,7
Mtmr6Q8VE11 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,85■■■□□ 2,69
Mtmr6Q8VE11 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Mtmr6Q8VE11 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Mtmr6Q8VE11 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Mtmr6Q8VE11 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31,62■■■□□ 2,65
Mtmr6Q8VE11 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,61■■■□□ 2,65
Mtmr6Q8VE11 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Mtmr6Q8VE11 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Mtmr6Q8VE11 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,57■■■□□ 2,64
Mtmr6Q8VE11 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Mtmr6Q8VE11 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,44■■■□□ 2,62
Mtmr6Q8VE11 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,41■■■□□ 2,62
Mtmr6Q8VE11 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,41■■■□□ 2,62
Mtmr6Q8VE11 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Mtmr6Q8VE11 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Mtmr6Q8VE11 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Mtmr6Q8VE11 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Mtmr6Q8VE11 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31,28■■■□□ 2,6
Mtmr6Q8VE11 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Mtmr6Q8VE11 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Mtmr6Q8VE11 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,12■■■□□ 2,57
Mtmr6Q8VE11 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Mtmr6Q8VE11 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,07■■■□□ 2,56
Mtmr6Q8VE11 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,07■■■□□ 2,56
Mtmr6Q8VE11 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Mtmr6Q8VE11 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Mtmr6Q8VE11 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Mtmr6Q8VE11 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Mtmr6Q8VE11 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Mtmr6Q8VE11 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Mtmr6Q8VE11 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Mtmr6Q8VE11 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Mtmr6Q8VE11 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Mtmr6Q8VE11 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Mtmr6Q8VE11 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Mtmr6Q8VE11 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Mtmr6Q8VE11 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,64■■■□□ 2,49
Mtmr6Q8VE11 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Mtmr6Q8VE11 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Mtmr6Q8VE11 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Mtmr6Q8VE11 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Mtmr6Q8VE11 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Mtmr6Q8VE11 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Mtmr6Q8VE11 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Mtmr6Q8VE11 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Mtmr6Q8VE11 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30,3■■■□□ 2,44
Mtmr6Q8VE11 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Mtmr6Q8VE11 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Mtmr6Q8VE11 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Mtmr6Q8VE11 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Mtmr6Q8VE11 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Mtmr6Q8VE11 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Mtmr6Q8VE11 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,6 ms