RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rnase13Q5GAM7 153 aa9.58□□□□□ -0.88
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ubr4A2AN08 5180 aa9.51□□□□□ -0.89
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 BC029722A0A0N4SW31 51 aa8.67□□□□□ -1.02
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap17-1A2A5X6 109 aa8.65□□□□□ -1.02
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa8.61□□□□□ -1.03
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm11562A0PK51 136 aa8.53□□□□□ -1.04
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm10061D3Z714 54 aa8.53□□□□□ -1.04
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm19426M0QWC7 77 aa8.52□□□□□ -1.04
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm11569B1AQB1 180 aa8.4□□□□□ -1.07
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm17402F6Z0L5 76 aa8.39□□□□□ -1.07
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm12216A0A1W2P827 62 aa8.36□□□□□ -1.07
Cbx1-201ENSMUST00000018810 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa8.33□□□□□ -1.08
Cbx1-201ENSMUST00000018810 SspoQ8CG65 4998 aa8.3□□□□□ -1.08
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Romo1P60603 79 aa8.26□□□□□ -1.09
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CriptO70333 101 aa8.26□□□□□ -1.09
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Spink7Q6IE32 76 aa8.25□□□□□ -1.09
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap12-1Q9Z287 130 aa8.18□□□□□ -1.1
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lce1gQ9D195 139 aa8.17□□□□□ -1.1
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm21887J3QQ04 176 aa7.99□□□□□ -1.13
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap9-5A2A5X3 358 aa7.97□□□□□ -1.13
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm11596B1AQB0 205 aa7.86□□□□□ -1.15
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Muc5bE9Q5I3 4800 aa7.82□□□□□ -1.16
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm19668J3QMD1 248 aa7.7□□□□□ -1.18
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lce1a2Q9D1K4 149 aa7.57□□□□□ -1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa7.54□□□□□ -1.2
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa7.5□□□□□ -1.21
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mp68P56379 58 aa7.45□□□□□ -1.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm11564A2A4L9 201 aa7.44□□□□□ -1.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm11595B1AQA7 289 aa7.44□□□□□ -1.22
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap4-8B1AQA8 209 aa7.44□□□□□ -1.22
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Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa7.3□□□□□ -1.24
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap8-1O08633 61 aa7.29□□□□□ -1.24
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa7.27□□□□□ -1.25
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa7.24□□□□□ -1.25
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap4-9B1AQA9 244 aa7.21□□□□□ -1.26
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tnp1P10856 55 aa7.13□□□□□ -1.27
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fsip2A2ARZ3 6995 aa7.12□□□□□ -1.27
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Mt4P47945 62 aa7.08□□□□□ -1.28
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap22-2J3QNX6 67 aa6.99□□□□□ -1.29
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm20538F6Z9R1 75 aa6.99□□□□□ -1.29
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa6.95□□□□□ -1.3
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa6.93□□□□□ -1.3
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lce1hQ9D6R3 140 aa6.92□□□□□ -1.3
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa6.89□□□□□ -1.31
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sprr2kO70562 68 aa6.78□□□□□ -1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lce1bQ9D149 137 aa6.78□□□□□ -1.32
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Krtap31-1Q9D644 177 aa6.76□□□□□ -1.33
Cbx1-201ENSMUST00000018810 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa6.73□□□□□ -1.33
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lce1a1Q9CQH5 143 aa6.73□□□□□ -1.33
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa6.69□□□□□ -1.34
Cbx1-201ENSMUST00000018810 2300003K06RikA2A4M0 262 aa6.67□□□□□ -1.34
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lce1lQ9D1G7 135 aa6.67□□□□□ -1.34
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