RNA–Protein interactions for RNA: YOR011W

AUS1, Transcript of Plasma membrane sterol transporter of the ATP-binding cassette family, yeast

Gene AUS1, Length 4,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AUS1	YOR011W	MSS18	P08593	268 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	CDC42	P19073	191 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MET4	P32389	672 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SEC66	P33754	206 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SHP1	P34223	423 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SPC34	P36131	295 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	DSF2	P38213	736 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SLM4	P38247	162 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YHR182W	P38870	785 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YJL107C	P42947	387 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YGL176C	P46945	554 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ISM1	P48526	1002 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MUB1	Q03162	620 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RSB1	Q08417	382 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	PSY3	Q12318	242 aa		3.36	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ERR1	P0CX10	437 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ERR2	P0CX11	437 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YKL100C	P34248	587 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YBR138C	P38277	524 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	FAA2	P39518	744 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	PRM2	P40534	656 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ERR3	P42222	437 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	FMP32	P43557	207 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MAD3	P47074	515 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YML020W	Q03722	664 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	DYN3	Q04949	312 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	CDC123	Q05791	360 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	GYP1	Q08484	637 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ZPS1	Q12512	249 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	IZH4	Q99393	312 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RHO2	P06781	192 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	TOM20	P35180	183 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	AST1	P35183	429 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MDJ1	P35191	511 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	TFA2	P36145	328 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	CDC27	P38042	758 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	KTR4	P38131	464 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	CYC2	P38909	366 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SWP82	P43554	623 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YPR003C	P53394	754 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SLM2	P53955	656 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	CSN9	Q03981	162 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RSC2	Q06488	889 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ARP7	Q12406	477 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	AVL9	Q12500	764 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RSR1	P13856	272 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	APE1	P14904	514 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	AMD2	P22580	549 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	GAC1	P28006	793 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	HSP78	P33416	811 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YHL041W	P38730	149 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RMR1	P53060	241 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	INA17	Q02888	182 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MMT1	Q03218	510 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	UGO1	Q03327	502 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	PEX12	Q04370	399 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	COS7	Q07788	383 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YPR027C	Q12079	277 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YLR125W	Q12138	136 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	YLL054C	Q12244	843 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	SAS5	Q99314	248 aa		3.35	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ATP4	P05626	244 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.34	□□□□□ -1.87	not detected
AUS1	YOR011W	GCN3	P14741	305 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MSS2	P40990	351 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	IAH1	P41734	238 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ELP2	P42935	788 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	NNF1	P47149	201 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	CTR1	P49573	406 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	TEP1	P53916	434 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	PET117	Q02771	107 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	CRN1	Q06440	651 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	UAF30	Q08747	228 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	RSA1	Q08932	381 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	ERP3	Q12403	225 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	MAS2	P11914	482 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	TMT1	P32643	299 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AUS1	YOR011W	TFB1	P32776	642 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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