RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W HMO1Q03973 246 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MCM21Q06675 368 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W HFI1Q12060 488 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YOR111WQ99210 232 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MPD2Q99316 277 aa2.43□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W TRA1P38811 3744 aa2.42□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W HAP2P06774 265 aa2.42□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SIR1P21691 654 aa2.42□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data2.42□□□□□ -2.02not detected
SSQ1YLR369W HEL1P36113 551 aa2.42□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MIP6P38760 659 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YGL081WP53156 320 aa2.42□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W ARG5,6Q01217 863 aa2.42□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W BRE1Q07457 700 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W CET1O13297 549 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SRD1P09007 221 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W GFA1P14742 717 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W HIR1P32479 840 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W VPH1P32563 840 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W TCD2P36101 447 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W LEU5P38702 357 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PCL5P38794 229 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W GID8P40208 455 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W DIP5P53388 608 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SSL2Q00578 843 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W RCR2Q03446 210 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YLR149CQ99296 730 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YBR056W-AI2HB52 66 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YEL1P34225 687 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W CUE2P36075 443 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W APT2P36973 181 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W RXT2P38255 430 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W CRP1P38845 465 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W REV7P38927 245 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PCF11P39081 626 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YER186CP40101 306 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W FIS1P40515 155 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W RMD8P43620 662 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W HLJ1P48353 224 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MNP1P53163 194 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W ADA2Q02336 434 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W COG8Q04632 607 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W DNL4Q08387 944 aaPredicted RBP2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W TAF3Q12297 353 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W NDJ1Q12366 352 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W APM4Q99186 491 aa2.41□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W CDC16P09798 840 aa2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W RNR3P21672 869 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MIH1P23748 554 aa2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W ILV6P25605 309 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W MRX3P38172 270 aa2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YHR112CP38716 378 aa2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W RPN10P38886 268 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W BFA1P47113 574 aa2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W VPS73P53142 486 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SDA1P53313 767 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W CNM67P53865 581 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W AIM33Q04516 312 aa2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YLR001CQ07895 862 aa2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W SMC5Q08204 1093 aa2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W ZPS1Q12512 249 aa2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa2.4□□□□□ -2.02
SSQ1YLR369W UTP20P35194 2493 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W RAD50P12753 1312 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W CLN3P13365 580 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W CDC43P18898 376 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W DMC1P25453 334 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W GPI10P30777 616 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W DPH2P32461 534 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W HOG1P32485 435 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W HIS7P33734 552 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W SIF2P38262 535 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W HSL7P38274 827 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W LYS9P38999 446 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W NUP60P39705 539 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W TAH11P47112 604 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W PCL10P53124 433 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W NMA2P53204 395 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W FHN1P53279 174 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W SPC98P53540 846 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W YDR341CQ05506 607 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W HEL2Q05580 639 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W CDC45Q08032 650 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W YPQ1Q12010 308 aa2.4□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W ILV1P00927 576 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W KIN3P22209 435 aa2.39□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W PPH22P23595 377 aa2.39□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W TSR4P25040 408 aa2.39□□□□□ -2.03
SSQ1YLR369W TFB1P32776 642 aa2.39□□□□□ -2.03
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