RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WYKR078W POL31P46957 487 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W MDV1P47025 714 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W PUS4P48567 403 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W YAT1P80235 687 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W CRF1Q04930 467 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W PHM6Q05637 104 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W SNA4Q07549 140 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W PFA4Q12006 378 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W ATX2Q12067 313 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W GET3Q12154 354 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W PEP1P32319 1579 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W PDR10P51533 1564 aa3.12□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W VBA2P38358 474 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W GND1P38720 489 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W AAT1Q01802 451 aa3.11□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W BUD7Q08754 746 aa3.11□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.11□□□□□ -1.91not detected
YKR078WYKR078W REV3P14284 1504 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W POL1P13382 1468 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W CTT1P06115 562 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W VAS1P07806 1104 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W SEC18P18759 758 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W PHO3P24031 467 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W GSH1P32477 678 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W RGT1P32862 1170 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W TOM71P38825 639 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W UBP7P40453 1071 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W YIR016WP40572 265 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W YPL191CQ08930 360 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W SCC2Q04002 1493 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W ADH4P10127 382 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W RPS7AP26786 190 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W GCS1P35197 352 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W CWC22P53333 577 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W VTC3Q02725 835 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W NUR1Q12066 484 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W UBX3Q12229 455 aa3.1□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W SSK2P53599 1579 aa3.09□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W SIN3P22579 1536 aa3.09□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W RNA1P11745 407 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W PAF1P38351 445 aa3.09□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W YIL152WP40455 235 aa3.09□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W IMA5P40884 581 aa3.09□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W YJL107CP42947 387 aa3.09□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W PEX14P53112 341 aa3.09□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W BOP3P53958 396 aa3.09□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W YNL034WP53963 612 aa3.09□□□□□ -1.91
YKR078WYKR078W HIR3P47171 1648 aa3.09□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W TY1B-DR4Q07793 1604 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W BPT1P14772 1559 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W CNA1P23287 553 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W PTC6P25646 442 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W SDS22P36047 338 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W RPF2P36160 344 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W TAF5P38129 798 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YLF2P38746 405 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W ERC1P38767 581 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W ORC5P50874 479 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W CRD1Q07560 283 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W AAD4Q07747 329 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W RRI1Q12468 440 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W SWR1Q05471 1514 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W MHP1P43638 1398 aa3.08□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W ILV2P07342 687 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W ROX1P25042 368 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W SCO2P38072 301 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W CNM67P53865 581 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W VPS64Q03944 604 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W AIM6Q07716 390 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W MYO4P32492 1471 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W MMS1Q06211 1407 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W MLP2P40457 1679 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YCR043CP25361 127 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W ARN1P38731 627 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W SWD1P39706 426 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W SAW1P39735 261 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W MAF1P41910 395 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W NPA3P47122 385 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W ESF2P53743 316 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W NDD1Q08887 554 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W LEA1Q08963 238 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YBR255C-AQ3E776 120 aa3.07□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W SIP1P32578 815 aa3.06□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YPT11P48559 417 aa3.06□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YPR003CP53394 754 aa3.06□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W NOP58Q12499 511 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YAT2P40017 923 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YIR014WP40570 242 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W TES1P41903 349 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W THI3Q07471 609 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W IRC20Q06554 1556 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W TSC11P40061 1430 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W PDE1P22434 369 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W ARC40P38328 384 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.5 ms