RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W FAR8Q05040 523 aa9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W SLD7Q08457 257 aa9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W NCA2Q12374 616 aa9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W AFI1Q99222 893 aa9.07□□□□□ -0.96
DDI1YER143W MIS1P09440 975 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
DDI1YER143W HMG2P12684 1045 aa9.06□□□□□ -0.96
DDI1YER143W SRV2P17555 526 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
DDI1YER143W SYN8P31377 255 aa9.06□□□□□ -0.96
DDI1YER143W SMI1P32566 505 aa9.06□□□□□ -0.96
DDI1YER143W SEC6P32844 805 aa9.06□□□□□ -0.96
DDI1YER143W ETR1P38071 380 aa9.06□□□□□ -0.96
DDI1YER143W YBR032WP38223 100 aa9.06□□□□□ -0.96
DDI1YER143W ELO3P40319 345 aa9.06□□□□□ -0.96
DDI1YER143W UFE1P41834 346 aa9.06□□□□□ -0.96
DDI1YER143W RPN4Q03465 531 aa9.06□□□□□ -0.96
DDI1YER143W ENT5Q03769 411 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
DDI1YER143W AAT2P23542 418 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
DDI1YER143W PPH22P23595 377 aa9.05□□□□□ -0.96
DDI1YER143W URA10P30402 227 aa9.05□□□□□ -0.96
DDI1YER143W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
DDI1YER143W RRN7P40992 514 aa9.05□□□□□ -0.96
DDI1YER143W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
DDI1YER143W MET14Q02196 202 aa9.05□□□□□ -0.96
DDI1YER143W ADI1Q03677 179 aa9.05□□□□□ -0.96
DDI1YER143W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
DDI1YER143W HOS1Q12214 470 aa9.05□□□□□ -0.96
DDI1YER143W SLP1Q12232 587 aa9.05□□□□□ -0.96
DDI1YER143W SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W HSF1P10961 833 aa9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W INO1P11986 533 aa9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W APE1P14904 514 aa9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W KAR9P32526 644 aa9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W ATG12P38316 186 aa9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W RGA1P39083 1007 aa9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W YJL107CP42947 387 aa9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W TRS85P46944 698 aa9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W CCT8P47079 568 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W MRS2Q01926 470 aa9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W YET3Q07451 203 aa9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W YLR012CQ07927 99 aa9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa9.04□□□□□ -0.96
DDI1YER143W GPA2P10823 449 aa9.03□□□□□ -0.96
DDI1YER143W PEX34P25584 144 aa9.03□□□□□ -0.96
DDI1YER143W HEM12P32347 362 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
DDI1YER143W MRS6P32864 603 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
DDI1YER143W PEX28P38848 579 aa9.03□□□□□ -0.96
DDI1YER143W VAC8P39968 578 aa9.03□□□□□ -0.96
DDI1YER143W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
DDI1YER143W TRF5P48561 642 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
DDI1YER143W ASN2P49090 572 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
DDI1YER143W PRP24P49960 444 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
DDI1YER143W ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data9.02□□□□□ -0.97not detected
DDI1YER143W YCL068CP25593 260 aa9.02□□□□□ -0.97
DDI1YER143W PAT1P25644 796 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
DDI1YER143W KIP2P28743 706 aa9.02□□□□□ -0.97
DDI1YER143W GDA1P32621 518 aa9.02□□□□□ -0.97
DDI1YER143W BEM3P32873 1128 aa9.02□□□□□ -0.97
DDI1YER143W SGE1P33335 543 aa9.02□□□□□ -0.97
DDI1YER143W BST1P43571 1029 aa9.02□□□□□ -0.97
DDI1YER143W STR3P53101 465 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
DDI1YER143W TIM13P53299 105 aa9.02□□□□□ -0.97
DDI1YER143W BIO4P53630 237 aa9.02□□□□□ -0.97
DDI1YER143W SIW14P53965 281 aa9.02□□□□□ -0.97
DDI1YER143W YPL014WQ02606 381 aa9.02□□□□□ -0.97
DDI1YER143W KEX2P13134 814 aa9.01□□□□□ -0.97
DDI1YER143W HSP60P19882 572 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
DDI1YER143W APM3P38153 483 aa9.01□□□□□ -0.97
DDI1YER143W PFK26P40433 827 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
DDI1YER143W IST3P40565 148 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
DDI1YER143W DSN1P40568 576 aa9.01□□□□□ -0.97
DDI1YER143W LSB6P42951 607 aa9.01□□□□□ -0.97
DDI1YER143W RLI1Q03195 608 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
DDI1YER143W YCS4Q06156 1176 aa9.01□□□□□ -0.97
DDI1YER143W ERF2Q06551 359 aa9.01□□□□□ -0.97
DDI1YER143W NDD1Q08887 554 aa9.01□□□□□ -0.97
DDI1YER143W PGC1Q08959 321 aa9.01□□□□□ -0.97
DDI1YER143W LDB17Q12342 491 aa9.01□□□□□ -0.97
DDI1YER143W HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data9□□□□□ -0.97not detected
DDI1YER143W CLN1P20437 546 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W NDI1P32340 513 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W ADD66P36040 267 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W POL12P38121 705 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W KTR4P38131 464 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W YBR062CP38239 180 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W SRP68P38687 599 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W REV7P38927 245 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W SEO1P39709 593 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W MOB1P40484 314 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W TDA10P42938 290 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W AMA1P50082 593 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W HST2P53686 357 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W YNR063WP53749 607 aa9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W ADE12P80210 433 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W RNY1Q02933 434 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
DDI1YER143W YMR206WQ03695 313 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.8 ms