RNA–Protein interactions for RNA: YBR194W

AIM4, Transcript of Protein proposed to be associated with the nuclear pore complex, yeast

Gene AIM4, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AIM4	YBR194W	SDH5	Q08230	162 aa		3.34	□□□□□ -1.87
AIM4	YBR194W	SEM1	O94742	89 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	URA3	P03962	267 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	SEC12	P11655	471 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	MRP7	P12687	371 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.33	□□□□□ -1.88	not detected
AIM4	YBR194W	ARG1	P22768	420 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	CBF2	P32504	956 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	CDC5	P32562	705 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	PAH1	P32567	862 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	DSS4	P32601	143 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	APD1	P38281	316 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	YER010C	P40011	234 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	NDE1	P40215	560 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	ESL1	P40456	1118 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	CAB2	P40506	365 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	GSM1	P42950	618 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	GAT1	P43574	510 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	SAE2	P46946	345 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	IRC3	Q06683	689 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	CIR2	Q08822	631 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	YLR111W	Q12528	110 aa		3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	RIT1	P23796	513 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	VPS8	P39702	1274 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	RIC1	P40395	1056 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	OPT1	P40897	799 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	BNA1	P47096	177 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	ATP23	P53722	227 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	SEC5	P89102	971 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	WAR1	Q03631	944 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	VPS64	Q03944	604 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	HRD3	Q05787	833 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	BSP1	Q06604	576 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	RGT2	Q12300	763 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	BET2	P20133	325 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	SWC3	P31376	625 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	YBR138C	P38277	524 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	VFA1	P40080	203 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	POL31	P46957	487 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	YJL043W	P47053	257 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	ATG21	Q02887	496 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	TRS31	Q03337	283 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	NBP2	Q12163	236 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	ERP4	Q12450	207 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	ENT1	Q12518	454 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	FOB1	O13329	566 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	CTT1	P06115	562 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	CDC16	P09798	840 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	SAN1	P22470	610 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	NFU1	P32860	256 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	CNS1	P33313	385 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	AXL2	P38928	823 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	COS12	P53053	380 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	MDG1	P53885	366 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	CBK1	P53894	756 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	STP1	Q00947	519 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	YPL068C	Q02749	293 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	RSC9	Q03124	581 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	ORM2	Q06144	216 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	GEP3	Q08622	556 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	TRM8	Q12009	286 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	TPK1	P06244	397 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	MRPL9	P31334	269 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	IFA38	P38286	347 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	SDH8	P38345	138 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	SGM1	P47166	707 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	BSC5	P53755	489 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	ACS1	Q01574	713 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	RAD33	Q04231	177 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	AIM6	Q07716	390 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	SCM3	Q12334	223 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	AAC3	P18238	307 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AIM4	YBR194W	MAK32	P23060	363 aa		3.28	□□□□□ -1.88

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