RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021306.13

Eftud2-201, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Eftud2, Length 3,324 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Zbtb43Q9DAI4 467 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Gdf11Q9Z1W4 405 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Usp17ldG5E8G2 545 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Usp17lcG5E8I7 545 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 U2af2P26369 475 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Traf5P70191 558 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Atp8a2P98200 1148 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Map10Q8BJS7 891 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Skor1Q8BX46 964 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 SdsQ8VBT2 327 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Riok1Q922Q2 567 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Nfatc2ipO09130 412 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Tyro3P55144 880 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Edrf1Q6GQV7 1239 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Znf771Q8BJ90 317 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Zfp317Q8C0Q5 607 aa9.28□□□□□ -0.92
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ces1hD3Z298 562 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Vmn2r23E9PXI5 849 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Serpinb2P12388 415 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 CebpaP53566 359 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Snrpa1P57784 255 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cplx2P84086 134 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 LyarQ08288 388 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Acnat2Q8BGG9 420 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 AbraQ8BUZ1 375 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Zbtb9Q8CDC7 459 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Gja10Q9WUS4 505 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cfap58B2RW38 873 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Lipo1J3QME6 396 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Kif3aP28741 701 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Irx2P81066 474 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Oog3Q3UWY1 500 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Efcc1Q9JJF6 558 aa9.27□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Oas2E9Q9A9 742 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Metap2O08663 478 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Slc4a4O88343 1079 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cap1P40124 474 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 TbcaP48428 108 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Irf6P97431 467 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Usp28Q5I043 1051 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Fez2Q6TYB5 348 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 9230110C19RikQ8CC70 267 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Kmt2eQ3UG20 1868 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Zkscan7E9PVW1 718 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Fam184aE9PW83 1143 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Dnm1P39053 867 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Spryd7Q3TFQ1 196 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Gas2l3Q3UWW6 683 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 E4f1Q8CCE9 783 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Atad2Q8CDM1 1040 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ppp4r3bQ922R5 820 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Krt84Q99M73 603 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ccdc81Q9D5W4 654 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Zbtb12Q9Z150 459 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 SisF8VQM5 1818 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ccdc173A0JLY1 547 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Mindy4Q3UQI9 744 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ces1dQ8VCT4 565 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 NsmfQ99NF2 532 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ralgps2Q9ERD6 590 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 ParvgQ9ERD8 331 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Psme4Q5SSW2 1843 aa9.26□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Tpd52l1O54818 204 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Mapkapk5O54992 473 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cyp2d9P11714 504 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Prl3d1P18121 224 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 RubcnlQ3TD16 648 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ncaph2Q8BSP2 607 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ift57Q8BXG3 429 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Pold4Q9CWP8 107 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ccdc47Q9D024 483 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Adarb2Q9JI20 745 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Cd2apQ9JLQ0 637 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Foxo4Q9WVH3 505 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Ankrd31A0A140LI88 1765 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Krt24A1L317 512 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Mageb2A2AHM0 380 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Phldb3E9QAF4 648 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Myl3P09542 204 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Sept1P42209 366 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 Kansl1lQ5DTI6 991 aa9.25□□□□□ -0.93
Eftud2-201ENSMUST00000021306 ZyxQ62523 564 aa9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.4 ms