Protein–RNA interactions for Protein: P39053

Dnm1, Dynamin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnm1P39053 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42,24■■■■■ 4,35
Dnm1P39053 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
Dnm1P39053 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38,78■■■■□ 3,8
Dnm1P39053 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Dnm1P39053 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Dnm1P39053 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,15■■■■□ 3,7
Dnm1P39053 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37,46■■■■□ 3,59
Dnm1P39053 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36,76■■■■□ 3,48
Dnm1P39053 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
Dnm1P39053 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36,7■■■■□ 3,47
Dnm1P39053 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36,35■■■■□ 3,41
Dnm1P39053 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Dnm1P39053 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Dnm1P39053 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,04■■■■□ 3,36
Dnm1P39053 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Dnm1P39053 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Dnm1P39053 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Dnm1P39053 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Dnm1P39053 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Dnm1P39053 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35,33■■■■□ 3,25
Dnm1P39053 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Dnm1P39053 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Dnm1P39053 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Dnm1P39053 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Dnm1P39053 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Dnm1P39053 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Dnm1P39053 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Dnm1P39053 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Dnm1P39053 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,08■■■■□ 3,21
Dnm1P39053 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Dnm1P39053 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Dnm1P39053 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Dnm1P39053 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,69■■■■□ 3,14
Dnm1P39053 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Dnm1P39053 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Dnm1P39053 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Dnm1P39053 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34,44■■■■□ 3,1
Dnm1P39053 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,38■■■■□ 3,09
Dnm1P39053 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Dnm1P39053 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Dnm1P39053 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Dnm1P39053 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Dnm1P39053 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,79■■■■□ 3
Dnm1P39053 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Dnm1P39053 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
Dnm1P39053 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Dnm1P39053 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,7■■■□□ 2,99
Dnm1P39053 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Dnm1P39053 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33,61■■■□□ 2,97
Dnm1P39053 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Dnm1P39053 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Dnm1P39053 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Dnm1P39053 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Dnm1P39053 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Dnm1P39053 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Dnm1P39053 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Dnm1P39053 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,19■■■□□ 2,9
Dnm1P39053 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33,17■■■□□ 2,9
Dnm1P39053 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Dnm1P39053 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Dnm1P39053 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Dnm1P39053 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,06■■■□□ 2,88
Dnm1P39053 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33,03■■■□□ 2,88
Dnm1P39053 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2,87
Dnm1P39053 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Dnm1P39053 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32,95■■■□□ 2,87
Dnm1P39053 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32,95■■■□□ 2,87
Dnm1P39053 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Dnm1P39053 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Dnm1P39053 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32,94■■■□□ 2,86
Dnm1P39053 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32,91■■■□□ 2,86
Dnm1P39053 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,81■■■□□ 2,84
Dnm1P39053 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,75■■■□□ 2,83
Dnm1P39053 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Dnm1P39053 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Dnm1P39053 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Dnm1P39053 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,57■■■□□ 2,8
Dnm1P39053 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Dnm1P39053 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,5■■■□□ 2,79
Dnm1P39053 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Dnm1P39053 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Dnm1P39053 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,35■■■□□ 2,77
Dnm1P39053 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
Dnm1P39053 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Dnm1P39053 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Dnm1P39053 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Dnm1P39053 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32,27■■■□□ 2,76
Dnm1P39053 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Dnm1P39053 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,75
Dnm1P39053 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32,26■■■□□ 2,75
Dnm1P39053 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32,21■■■□□ 2,75
Dnm1P39053 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Dnm1P39053 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Dnm1P39053 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Dnm1P39053 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Dnm1P39053 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Dnm1P39053 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Dnm1P39053 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,03■■■□□ 2,72
Dnm1P39053 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2,71
Dnm1P39053 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32■■■□□ 2,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms