Protein–RNA interactions for Protein: P39053

Dnm1, Dynamin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnm1P39053 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
Dnm1P39053 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Dnm1P39053 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Dnm1P39053 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Dnm1P39053 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Dnm1P39053 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Dnm1P39053 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Dnm1P39053 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Dnm1P39053 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Dnm1P39053 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Dnm1P39053 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Dnm1P39053 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Dnm1P39053 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Dnm1P39053 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Dnm1P39053 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Dnm1P39053 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Dnm1P39053 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Dnm1P39053 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Dnm1P39053 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Dnm1P39053 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Dnm1P39053 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Dnm1P39053 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Dnm1P39053 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Dnm1P39053 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Dnm1P39053 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Dnm1P39053 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Dnm1P39053 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Dnm1P39053 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Dnm1P39053 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Dnm1P39053 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Dnm1P39053 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Dnm1P39053 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Dnm1P39053 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Dnm1P39053 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Dnm1P39053 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Dnm1P39053 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Dnm1P39053 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Dnm1P39053 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Dnm1P39053 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Dnm1P39053 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Dnm1P39053 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Dnm1P39053 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Dnm1P39053 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Dnm1P39053 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Dnm1P39053 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Dnm1P39053 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Dnm1P39053 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Dnm1P39053 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Dnm1P39053 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Dnm1P39053 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Dnm1P39053 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Dnm1P39053 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Dnm1P39053 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Dnm1P39053 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Dnm1P39053 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Dnm1P39053 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Dnm1P39053 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Dnm1P39053 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Dnm1P39053 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Dnm1P39053 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Dnm1P39053 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Dnm1P39053 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Dnm1P39053 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Dnm1P39053 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Dnm1P39053 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Dnm1P39053 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Dnm1P39053 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Dnm1P39053 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Dnm1P39053 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Dnm1P39053 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Dnm1P39053 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Dnm1P39053 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Dnm1P39053 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Dnm1P39053 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Dnm1P39053 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Dnm1P39053 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Dnm1P39053 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Dnm1P39053 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Dnm1P39053 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Dnm1P39053 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Dnm1P39053 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Dnm1P39053 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Dnm1P39053 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Dnm1P39053 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dnm1P39053 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dnm1P39053 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Dnm1P39053 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Dnm1P39053 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Dnm1P39053 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Dnm1P39053 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Dnm1P39053 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Dnm1P39053 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Dnm1P39053 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Dnm1P39053 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Dnm1P39053 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Dnm1P39053 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Dnm1P39053 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Dnm1P39053 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Dnm1P39053 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Dnm1P39053 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms