RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Wdfy3Q6VNB8 3508 aa8.31□□□□□ -1.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Vps13cQ8BX70 3748 aa8.29□□□□□ -1.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pkd1l1Q8R526 2615 aa8.29□□□□□ -1.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dmxl2Q8BPN8 3032 aa8.29□□□□□ -1.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 SmcpP15265 143 aa8.28□□□□□ -1.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NbeaQ9EPN1 2936 aa8.26□□□□□ -1.09
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 VcanQ62059 3357 aa8.26□□□□□ -1.09
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dchs1E9PVD3 3291 aa8.23□□□□□ -1.09
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Igfn1Q3KNY0 2849 aa8.22□□□□□ -1.09
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hivep1Q03172 2688 aa8.2□□□□□ -1.1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Col6a5A6H584 2640 aa8.2□□□□□ -1.1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zzef1Q5SSH7 2924 aa8.15□□□□□ -1.1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Akap9Q70FJ1 3797 aa8.12□□□□□ -1.11
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tenm4Q3UHK6 2771 aa8.11□□□□□ -1.11
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 ApcQ61315 2845 aa8.11□□□□□ -1.11
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 FcgbpE9Q0B5 2583 aa8.09□□□□□ -1.11
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 TgO08710 2766 aa8.08□□□□□ -1.12
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa8.04□□□□□ -1.12
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tex15F8VPN2 2785 aa7.98□□□□□ -1.13
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm20537G3UYK7 97 aa7.95□□□□□ -1.14
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Csmd1Q923L3 3564 aa7.85□□□□□ -1.15
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa7.84□□□□□ -1.15
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pdzd2E9Q1M1 2796 aa7.76□□□□□ -1.17
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa7.75□□□□□ -1.17
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Chd9Q8BYH8 2885 aa7.75□□□□□ -1.17
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa7.75□□□□□ -1.17
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nf1Q04690 2841 aa7.72□□□□□ -1.17
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm9112A2AI92 75 aa7.71□□□□□ -1.18
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lama5Q61001 3718 aa7.69□□□□□ -1.18
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tenm2Q9WTS5 2764 aa7.62□□□□□ -1.19
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm17416Q30KP4 66 aa7.6□□□□□ -1.19
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm884A2A9H6 3643 aa7.6□□□□□ -1.19
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tenm1Q9WTS4 2731 aa7.5□□□□□ -1.21
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfhx4Q9JJN2 3550 aa7.46□□□□□ -1.21
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap19-5O08632 62 aa7.44□□□□□ -1.22
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cmya5Q70KF4 3739 aa7.4□□□□□ -1.22
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ank2Q8C8R3 3898 aa7.38□□□□□ -1.23
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm11939A2A592 99 aa7.32□□□□□ -1.24
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Svep1A2AVA0 3567 aa7.32□□□□□ -1.24
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm17402F6Z0L5 76 aa7.31□□□□□ -1.24
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm19668J3QMD1 248 aa7.3□□□□□ -1.24
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap13-1Q8K198 168 aa7.29□□□□□ -1.24
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Csmd2V9GX34 3611 aa7.19□□□□□ -1.26
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 VwfQ8CIZ8 2813 aa7.18□□□□□ -1.26
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Huwe1Q7TMY8 4377 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.28
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 4933428G20RikQ9D3X4 101 aa7.05□□□□□ -1.28
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap3-1A2A591 98 aa7.04□□□□□ -1.28
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Megf8P60882 2789 aa7.02□□□□□ -1.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dnah14A0A140LIJ4 4489 aa7□□□□□ -1.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap3-2Q9D638 99 aa6.98□□□□□ -1.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa6.98□□□□□ -1.29
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 LystP97412 3788 aa6.9□□□□□ -1.3
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Col7a1Q63870 2944 aa6.9□□□□□ -1.3
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm6358A0A087WPH4 74 aa6.83□□□□□ -1.32
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm18596A0A1W2P860 280 aa6.78□□□□□ -1.32
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dnah10D3YYQ8 4591 aa6.74□□□□□ -1.33
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Ubash3b-201ENSMUST00000044155 LorP18165 486 aa6.66□□□□□ -1.34
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Muc6Q80T03 2850 aa6.64□□□□□ -1.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hspg2Q05793 3707 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap1-5A2A590 122 aa6.61□□□□□ -1.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sprr2kO70562 68 aa6.61□□□□□ -1.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dnah5Q8VHE6 4621 aa6.59□□□□□ -1.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap19-9aF8WH65 55 aa6.59□□□□□ -1.35
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap8-1O08633 61 aa6.59□□□□□ -1.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Csmd3Q80T79 3707 aa6.57□□□□□ -1.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CubnQ9JLB4 3623 aa6.56□□□□□ -1.36
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa6.51□□□□□ -1.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dnah17Q69Z23 4481 aa6.5□□□□□ -1.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Xirp2Q4U4S6 3784 aa6.5□□□□□ -1.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sprr2a3Q4KL71 83 aa6.49□□□□□ -1.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa6.49□□□□□ -1.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa6.48□□□□□ -1.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Vps13dB1ART2 4390 aa6.47□□□□□ -1.37
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm19402J3QJV4 266 aa6.44□□□□□ -1.38
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