RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042850.8

Svep1-201, Transcript of Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Svep1, Length 11,629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap10-4Q08EG8 221 aa5.1□□□□□ -1.59
Svep1-201ENSMUST00000042850 Lama1P19137 3084 aa5.08□□□□□ -1.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa5.06□□□□□ -1.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Tenm4Q3UHK6 2771 aa5.05□□□□□ -1.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 Vps13aQ5H8C4 3166 aa5.05□□□□□ -1.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 HttP42859 3119 aa5.03□□□□□ -1.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 2310061N02RikQ9D6S9 174 aa5.03□□□□□ -1.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 2310057N15RikQ9D6T8 200 aa5.03□□□□□ -1.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 VwfQ8CIZ8 2813 aa5.03□□□□□ -1.6
Svep1-201ENSMUST00000042850 AtmQ62388 3066 aa5.02□□□□□ -1.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm5965D3Z724 196 aa5.01□□□□□ -1.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Frem2Q6NVD0 3160 aa4.97□□□□□ -1.61
Svep1-201ENSMUST00000042850 Col12a1Q60847 3120 aa4.96□□□□□ -1.62
Svep1-201ENSMUST00000042850 Usp34Q6ZQ93 3582 aa4.96□□□□□ -1.62
Svep1-201ENSMUST00000042850 Mki67E9PVX6 3177 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
Svep1-201ENSMUST00000042850 SmcpP15265 143 aa4.95□□□□□ -1.62
Svep1-201ENSMUST00000042850 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa4.94□□□□□ -1.62
Svep1-201ENSMUST00000042850 AspmQ8CJ27 3122 aa4.92□□□□□ -1.62
Svep1-201ENSMUST00000042850 A930033H14RikG5E8X6 103 aa4.92□□□□□ -1.62
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm2696A0A1W2P709 240 aa4.92□□□□□ -1.62
Svep1-201ENSMUST00000042850 Lama3Q61789 3330 aa4.92□□□□□ -1.62
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm20537G3UYK7 97 aa4.89□□□□□ -1.63
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm9918Q8BUR5 174 aa4.87□□□□□ -1.63
Svep1-201ENSMUST00000042850 Prm2P07978 107 aa4.83□□□□□ -1.64
Svep1-201ENSMUST00000042850 Adgrg4B7ZCC9 3073 aa4.83□□□□□ -1.64
Svep1-201ENSMUST00000042850 Tenm2Q9WTS5 2764 aa4.82□□□□□ -1.64
Svep1-201ENSMUST00000042850 4933428G20RikQ9D3X4 101 aa4.82□□□□□ -1.64
Svep1-201ENSMUST00000042850 Unc80Q8BLN6 3261 aa4.8□□□□□ -1.64
Svep1-201ENSMUST00000042850 Myo15aQ9QZZ4 3511 aa4.78□□□□□ -1.64
Svep1-201ENSMUST00000042850 Zfhx3Q61329 3726 aa4.75□□□□□ -1.65
Svep1-201ENSMUST00000042850 Helz2E9QAM5 2947 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
Svep1-201ENSMUST00000042850 Lrrc37aB1AWG4 3215 aa4.74□□□□□ -1.65
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm17402F6Z0L5 76 aa4.69□□□□□ -1.66
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm17416Q30KP4 66 aa4.68□□□□□ -1.66
Svep1-201ENSMUST00000042850 Celsr3Q91ZI0 3301 aa4.67□□□□□ -1.66
Svep1-201ENSMUST00000042850 OtogO55225 2910 aa4.65□□□□□ -1.67
Svep1-201ENSMUST00000042850 Col7a1Q63870 2944 aa4.61□□□□□ -1.67
Svep1-201ENSMUST00000042850 Akap9Q70FJ1 3797 aa4.59□□□□□ -1.67
Svep1-201ENSMUST00000042850 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa4.58□□□□□ -1.68
Svep1-201ENSMUST00000042850 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa4.58□□□□□ -1.68
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm19668J3QMD1 248 aa4.56□□□□□ -1.68
Svep1-201ENSMUST00000042850 Ank2Q8C8R3 3898 aa4.53□□□□□ -1.68
Svep1-201ENSMUST00000042850 Dchs2A0A0A6YW72 3346 aa4.5□□□□□ -1.69
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa4.48□□□□□ -1.69
Svep1-201ENSMUST00000042850 DmdP11531 3678 aa4.45□□□□□ -1.7
Svep1-201ENSMUST00000042850 Fbn1Q61554 2873 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
Svep1-201ENSMUST00000042850 Cdh23Q99PF4 3354 aa4.45□□□□□ -1.7
Svep1-201ENSMUST00000042850 SpegQ62407 3262 aa4.45□□□□□ -1.7
Svep1-201ENSMUST00000042850 Brca2P97929 3329 aa4.43□□□□□ -1.7
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm10318A0A1W2P728 225 aa4.41□□□□□ -1.7
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm6358A0A087WPH4 74 aa4.39□□□□□ -1.71
Svep1-201ENSMUST00000042850 Col6a3E9PWQ3 3284 aa4.38□□□□□ -1.71
Svep1-201ENSMUST00000042850 Szt2A2A9C3 3431 aa4.36□□□□□ -1.71
Svep1-201ENSMUST00000042850 Vps13cQ8BX70 3748 aa4.35□□□□□ -1.71
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap13-1Q8K198 168 aa4.29□□□□□ -1.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 Muc6Q80T03 2850 aa4.28□□□□□ -1.72
Svep1-201ENSMUST00000042850 VcanQ62059 3357 aa4.26□□□□□ -1.73
Svep1-201ENSMUST00000042850 BsnO88737 3942 aa4.26□□□□□ -1.73
Svep1-201ENSMUST00000042850 Crct1Q6PAI5 102 aa4.26□□□□□ -1.73
Svep1-201ENSMUST00000042850 SpenQ62504 3644 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
Svep1-201ENSMUST00000042850 Cmya5Q70KF4 3739 aa4.22□□□□□ -1.73
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm18596A0A1W2P860 280 aa4.22□□□□□ -1.73
Svep1-201ENSMUST00000042850 Dchs1E9PVD3 3291 aa4.19□□□□□ -1.74
Svep1-201ENSMUST00000042850 Sprr2kO70562 68 aa4.17□□□□□ -1.74
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm11939A2A592 99 aa4.14□□□□□ -1.75
Svep1-201ENSMUST00000042850 Muc5acE9QAQ8 3455 aa4.14□□□□□ -1.75
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap19-5O08632 62 aa4.13□□□□□ -1.75
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm19402J3QJV4 266 aa4.11□□□□□ -1.75
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap8-1O08633 61 aa4.1□□□□□ -1.75
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap3-1A2A591 98 aa4.09□□□□□ -1.76
Svep1-201ENSMUST00000042850 Wdfy3Q6VNB8 3508 aa4.07□□□□□ -1.76
Svep1-201ENSMUST00000042850 RelnQ60841 3461 aa4.05□□□□□ -1.76
Svep1-201ENSMUST00000042850 Smg1Q8BKX6 3658 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa4.05□□□□□ -1.76
Svep1-201ENSMUST00000042850 Muc4Q8JZM8 3443 aa4.03□□□□□ -1.76
Svep1-201ENSMUST00000042850 Sprr2gO70558 76 aa3.99□□□□□ -1.77
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap19-9aF8WH65 55 aa3.99□□□□□ -1.77
Svep1-201ENSMUST00000042850 Lama5Q61001 3718 aa3.97□□□□□ -1.77
Svep1-201ENSMUST00000042850 Csmd1Q923L3 3564 aa3.93□□□□□ -1.78
Svep1-201ENSMUST00000042850 LystP97412 3788 aa3.92□□□□□ -1.78
Svep1-201ENSMUST00000042850 Csmd2V9GX34 3611 aa3.9□□□□□ -1.78
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa3.9□□□□□ -1.78
Svep1-201ENSMUST00000042850 Zfhx4Q9JJN2 3550 aa3.89□□□□□ -1.79
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap3-2Q9D638 99 aa3.89□□□□□ -1.79
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa3.89□□□□□ -1.79
Svep1-201ENSMUST00000042850 Huwe1Q7TMY8 4377 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap1-5A2A590 122 aa3.86□□□□□ -1.79
Svep1-201ENSMUST00000042850 Sprr2a3Q4KL71 83 aa3.85□□□□□ -1.79
Svep1-201ENSMUST00000042850 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa3.85□□□□□ -1.79
Svep1-201ENSMUST00000042850 Dnah3Q8BW94 4083 aa3.83□□□□□ -1.8
Svep1-201ENSMUST00000042850 Csmd3Q80T79 3707 aa3.82□□□□□ -1.8
Svep1-201ENSMUST00000042850 Dnah7bL7N1Y0 4068 aa3.81□□□□□ -1.8
Svep1-201ENSMUST00000042850 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa3.79□□□□□ -1.8
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap12-1Q9Z287 130 aa3.78□□□□□ -1.8
Svep1-201ENSMUST00000042850 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa3.76□□□□□ -1.81
Svep1-201ENSMUST00000042850 Dnah7aE9Q0T8 4024 aa3.76□□□□□ -1.81
Svep1-201ENSMUST00000042850 Gm884A2A9H6 3643 aa3.75□□□□□ -1.81
Svep1-201ENSMUST00000042850 LorP18165 486 aa3.72□□□□□ -1.81
Svep1-201ENSMUST00000042850 Lce3bQ9CQM7 98 aa3.71□□□□□ -1.82
Svep1-201ENSMUST00000042850 Xirp2Q4U4S6 3784 aa3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 88.1 ms