Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38,28■■■■□ 3,72
Lama1P19137 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Lama1P19137 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Lama1P19137 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,62■■■□□ 2,97
Lama1P19137 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,78■■■□□ 2,84
Lama1P19137 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Lama1P19137 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
Lama1P19137 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32,3■■■□□ 2,76
Lama1P19137 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
Lama1P19137 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,98■■■□□ 2,71
Lama1P19137 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,68■■■□□ 2,66
Lama1P19137 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,43■■■□□ 2,62
Lama1P19137 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Lama1P19137 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Lama1P19137 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Lama1P19137 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,92■■■□□ 2,54
Lama1P19137 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Lama1P19137 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Lama1P19137 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Lama1P19137 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Lama1P19137 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,56■■■□□ 2,48
Lama1P19137 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Lama1P19137 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Lama1P19137 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Lama1P19137 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Lama1P19137 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Lama1P19137 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Lama1P19137 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,68■■■□□ 2,34
Lama1P19137 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,64■■■□□ 2,33
Lama1P19137 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Lama1P19137 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Lama1P19137 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Lama1P19137 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Lama1P19137 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Lama1P19137 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Lama1P19137 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Lama1P19137 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Lama1P19137 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Lama1P19137 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Lama1P19137 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Lama1P19137 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Lama1P19137 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29■■■□□ 2,23
Lama1P19137 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Lama1P19137 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Lama1P19137 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,87■■■□□ 2,21
Lama1P19137 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Lama1P19137 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Lama1P19137 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Lama1P19137 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Lama1P19137 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,7■■■□□ 2,19
Lama1P19137 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Lama1P19137 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Lama1P19137 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Lama1P19137 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
Lama1P19137 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Lama1P19137 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Lama1P19137 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Lama1P19137 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Lama1P19137 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Lama1P19137 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Lama1P19137 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Lama1P19137 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Lama1P19137 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Lama1P19137 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Lama1P19137 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Lama1P19137 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,08■■■□□ 2,08
Lama1P19137 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Lama1P19137 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Lama1P19137 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Lama1P19137 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Lama1P19137 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Lama1P19137 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Lama1P19137 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,86■■■□□ 2,05
Lama1P19137 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Lama1P19137 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Lama1P19137 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Lama1P19137 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Lama1P19137 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Lama1P19137 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,67■■■□□ 2,02
Lama1P19137 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Lama1P19137 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Lama1P19137 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Lama1P19137 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Lama1P19137 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Lama1P19137 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Lama1P19137 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Lama1P19137 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,47■■□□□ 1,99
Lama1P19137 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Lama1P19137 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Lama1P19137 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Lama1P19137 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lama1P19137 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Lama1P19137 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Lama1P19137 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,29■■□□□ 1,96
Lama1P19137 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Lama1P19137 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Lama1P19137 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Lama1P19137 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Lama1P19137 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,25■■□□□ 1,95
Lama1P19137 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,3 ms