RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077337.8

Irx1-201, Transcript of Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Irx1, Length 2,373 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1-201ENSMUST00000077337 Defa4P28311 92 aa14.73□□□□□ -0.05
Irx1-201ENSMUST00000077337 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Irx1-201ENSMUST00000077337 MplkipQ9D011 178 aa14.73□□□□□ -0.05
Irx1-201ENSMUST00000077337 Trav14-1A0A0G2JF94 121 aa14.71□□□□□ -0.05
Irx1-201ENSMUST00000077337 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa14.71□□□□□ -0.05
Irx1-201ENSMUST00000077337 9530003J23RikQ8BM26 151 aa14.71□□□□□ -0.05
Irx1-201ENSMUST00000077337 Smim29Q8R043 75 aa14.71□□□□□ -0.05
Irx1-201ENSMUST00000077337 Smim20D3Z7Q2 69 aa14.7□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Tmem254aP0DN89 123 aa14.7□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Tmem254bP0DN90 123 aa14.7□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Tmem254cP0DN91 123 aa14.7□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Cdk2ap2Q9CPY4 127 aa14.7□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm16181B0V2H2 73 aa14.69□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Wfdc17Q5SSJ1 76 aa14.69□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Dnah14A0A140LIJ4 4489 aa14.69□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 6430550D23RikE9Q1X6 194 aa14.69□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Sslp1Q3UN54 99 aa14.68□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm10308Q9CVR5 141 aa14.68□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 SmcpP15265 143 aa14.67□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Elof1P60003 83 aa14.67□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Fam19a1Q7TPG8 133 aa14.66□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Dnah7bL7N1Y0 4068 aa14.66□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Dnah6E9Q0B6 4144 aa14.66□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Naa38Q9D2U5 125 aa14.65□□□□□ -0.06
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm20726G3UX18 150 aa14.65□□□□□ -0.07
Irx1-201ENSMUST00000077337 BC048502Q80Y74 154 aa14.64□□□□□ -0.07
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm16485Q8C4B7 115 aa14.63□□□□□ -0.07
Irx1-201ENSMUST00000077337 Ubl5Q9EPV8 73 aa14.63□□□□□ -0.07
Irx1-201ENSMUST00000077337 A730071L15RikQ8C4X0 137 aa14.62□□□□□ -0.07
Irx1-201ENSMUST00000077337 Igkv1-122A0A140T8M9 119 aa14.61□□□□□ -0.07
Irx1-201ENSMUST00000077337 Defa7P50705 93 aa14.61□□□□□ -0.07
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm3618D3Z4P5 127 aa14.6□□□□□ -0.07
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm2916Q9D9B9 127 aa14.6□□□□□ -0.07
Irx1-201ENSMUST00000077337 Inafm2A0A1L1STD6 152 aa14.6□□□□□ -0.07
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm5617Q91VN2 117 aa14.58□□□□□ -0.08
Irx1-201ENSMUST00000077337 Rbm3O89086 153 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Irx1-201ENSMUST00000077337 ScxQ64124 207 aa14.57□□□□□ -0.08
Irx1-201ENSMUST00000077337 Fam229bQ8CF36 80 aa14.56□□□□□ -0.08
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm17689B3GLJ4 109 aa14.55□□□□□ -0.08
Irx1-201ENSMUST00000077337 Ighv2-5A0A0A6YY69 116 aa14.55□□□□□ -0.08
Irx1-201ENSMUST00000077337 Pou2af1Q64693 256 aa14.54□□□□□ -0.08
Irx1-201ENSMUST00000077337 Fam168bQ80XQ8 194 aa14.54□□□□□ -0.08
Irx1-201ENSMUST00000077337 Igkv8-28A0A0G2JE47 121 aa14.53□□□□□ -0.08
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm7276Q3TYW4 209 aa14.52□□□□□ -0.09
Irx1-201ENSMUST00000077337 A0A286YE02 88 aa14.5□□□□□ -0.09
Irx1-201ENSMUST00000077337 Serp2Q6TAW2 65 aa14.5□□□□□ -0.09
Irx1-201ENSMUST00000077337 Defa21Q8C1P2 93 aa14.5□□□□□ -0.09
Irx1-201ENSMUST00000077337 Dnah17Q69Z23 4481 aa14.5□□□□□ -0.09
Irx1-201ENSMUST00000077337 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa14.49□□□□□ -0.09
Irx1-201ENSMUST00000077337 Vpreb2P13373 142 aa14.48□□□□□ -0.09
Irx1-201ENSMUST00000077337 Dnah1E9Q8T7 4250 aa14.47□□□□□ -0.09
Irx1-201ENSMUST00000077337 Tmem243B2RVB9 118 aa14.47□□□□□ -0.09
Irx1-201ENSMUST00000077337 Sprr1aQ62266 144 aa14.47□□□□□ -0.09
Irx1-201ENSMUST00000077337 P84750 121 aa14.46□□□□□ -0.09
Irx1-201ENSMUST00000077337 Csmd3Q80T79 3707 aa14.45□□□□□ -0.1
Irx1-201ENSMUST00000077337 Igkv1-110A0A0B4J1I0 119 aa14.45□□□□□ -0.1
Irx1-201ENSMUST00000077337 Pde6gP09174 87 aa14.44□□□□□ -0.1
Irx1-201ENSMUST00000077337 A830005F24RikQ8BRT5 167 aa14.44□□□□□ -0.1
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm11627A6PWP4 55 aa14.42□□□□□ -0.1
Irx1-201ENSMUST00000077337 Defa23Q5G866 93 aa14.41□□□□□ -0.1
Irx1-201ENSMUST00000077337 Scgb1b2O35176 93 aa14.41□□□□□ -0.1
Irx1-201ENSMUST00000077337 Fam19a3Q7TPG6 132 aa14.41□□□□□ -0.1
Irx1-201ENSMUST00000077337 Dmac1Q9CQ00 111 aa14.41□□□□□ -0.1
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm9508A0A1W2P7W0 230 aa14.4□□□□□ -0.1
Irx1-201ENSMUST00000077337 A330070K13RikQ8CA53 115 aa14.4□□□□□ -0.1
Irx1-201ENSMUST00000077337 Fam19a5Q91WE9 132 aa14.4□□□□□ -0.1
Irx1-201ENSMUST00000077337 Wfdc6bF6ULY1 148 aa14.4□□□□□ -0.1
Irx1-201ENSMUST00000077337 Defb10Q8R2I8 73 aa14.39□□□□□ -0.11
Irx1-201ENSMUST00000077337 Obox2E9PXV9 151 aa14.37□□□□□ -0.11
Irx1-201ENSMUST00000077337 Igkv3-2A0A075B5P0 119 aa14.36□□□□□ -0.11
Irx1-201ENSMUST00000077337 Ighv2-2A0A075B5P8 116 aa14.36□□□□□ -0.11
Irx1-201ENSMUST00000077337 P01821 116 aa14.36□□□□□ -0.11
Irx1-201ENSMUST00000077337 Sfta2E9PXB6 77 aa14.34□□□□□ -0.11
Irx1-201ENSMUST00000077337 Igkv3-12A0A140T8P0 119 aa14.33□□□□□ -0.12
Irx1-201ENSMUST00000077337 BaalcQ8VHV1 145 aa14.32□□□□□ -0.12
Irx1-201ENSMUST00000077337 B230307C23RikQ8BLB2 64 aa14.32□□□□□ -0.12
Irx1-201ENSMUST00000077337 P06320 134 aa14.31□□□□□ -0.12
Irx1-201ENSMUST00000077337 Cox6a2P43023 97 aa14.31□□□□□ -0.12
Irx1-201ENSMUST00000077337 TgO08710 2766 aa14.29□□□□□ -0.12
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm11011D3Z3L9 86 aa14.29□□□□□ -0.12
Irx1-201ENSMUST00000077337 Prol1E9PYQ4 312 aa14.29□□□□□ -0.12
Irx1-201ENSMUST00000077337 Sprr2jO70561 109 aa14.29□□□□□ -0.12
Irx1-201ENSMUST00000077337 PscaP57096 123 aa14.28□□□□□ -0.12
Irx1-201ENSMUST00000077337 Vpreb1P13372 142 aa14.27□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 Spata3Q9D9T6 193 aa14.27□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm37389A0A0A6YW05 95 aa14.26□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 A930002H24RikQ8C8Y3 163 aa14.26□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 2310061N02RikQ9D6S9 174 aa14.26□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 Megf8P60882 2789 aa14.25□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 GhrhP16043 103 aa14.25□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 Vpreb3D3Z6J4 130 aa14.24□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 BikO70337 150 aa14.24□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 Ube2bP63147 152 aa14.23□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 Defa28D3Z1V9 94 aa14.22□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 Ndufc1Q9CQY9 76 aa14.22□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 Tmem258P61166 79 aa14.21□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 C130032M10RikQ8C888 123 aa14.21□□□□□ -0.13
Irx1-201ENSMUST00000077337 Defb40Q70KL2 73 aa14.19□□□□□ -0.14
Irx1-201ENSMUST00000077337 Gm10401E9Q3K6 71 aa14.18□□□□□ -0.14
Irx1-201ENSMUST00000077337 Prr15lQ8JZM2 100 aa14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10 ms