Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23,73■■□□□ 1,39
Sprr1aQ62266 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
Sprr1aQ62266 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Sprr1aQ62266 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Sprr1aQ62266 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Sprr1aQ62266 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Sprr1aQ62266 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,1■□□□□ 0,97
Sprr1aQ62266 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Sprr1aQ62266 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20,71■□□□□ 0,91
Sprr1aQ62266 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20,69■□□□□ 0,9
Sprr1aQ62266 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20,42■□□□□ 0,86
Sprr1aQ62266 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Sprr1aQ62266 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,32■□□□□ 0,84
Sprr1aQ62266 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,31■□□□□ 0,84
Sprr1aQ62266 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Sprr1aQ62266 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Sprr1aQ62266 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Sprr1aQ62266 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Sprr1aQ62266 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Sprr1aQ62266 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Sprr1aQ62266 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Sprr1aQ62266 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Sprr1aQ62266 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19,86■□□□□ 0,77
Sprr1aQ62266 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Sprr1aQ62266 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19,81■□□□□ 0,76
Sprr1aQ62266 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Sprr1aQ62266 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Sprr1aQ62266 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Sprr1aQ62266 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Sprr1aQ62266 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Sprr1aQ62266 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Sprr1aQ62266 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19,58■□□□□ 0,73
Sprr1aQ62266 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Sprr1aQ62266 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Sprr1aQ62266 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,51■□□□□ 0,71
Sprr1aQ62266 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19,4■□□□□ 0,7
Sprr1aQ62266 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Sprr1aQ62266 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19,34■□□□□ 0,69
Sprr1aQ62266 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
Sprr1aQ62266 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
Sprr1aQ62266 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19,24■□□□□ 0,67
Sprr1aQ62266 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
Sprr1aQ62266 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19,05■□□□□ 0,64
Sprr1aQ62266 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Sprr1aQ62266 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19,03■□□□□ 0,64
Sprr1aQ62266 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,64
Sprr1aQ62266 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Sprr1aQ62266 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,95■□□□□ 0,62
Sprr1aQ62266 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Sprr1aQ62266 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18,83■□□□□ 0,6
Sprr1aQ62266 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Sprr1aQ62266 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,81■□□□□ 0,6
Sprr1aQ62266 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18,79■□□□□ 0,6
Sprr1aQ62266 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Sprr1aQ62266 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Sprr1aQ62266 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Sprr1aQ62266 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Sprr1aQ62266 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Sprr1aQ62266 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Sprr1aQ62266 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18,63■□□□□ 0,57
Sprr1aQ62266 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18,61■□□□□ 0,57
Sprr1aQ62266 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,6■□□□□ 0,57
Sprr1aQ62266 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,6■□□□□ 0,57
Sprr1aQ62266 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,58■□□□□ 0,56
Sprr1aQ62266 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18,58■□□□□ 0,56
Sprr1aQ62266 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,58■□□□□ 0,56
Sprr1aQ62266 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18,57■□□□□ 0,56
Sprr1aQ62266 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18,55■□□□□ 0,56
Sprr1aQ62266 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18,55■□□□□ 0,56
Sprr1aQ62266 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18,53■□□□□ 0,56
Sprr1aQ62266 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,48■□□□□ 0,55
Sprr1aQ62266 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,41■□□□□ 0,54
Sprr1aQ62266 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18,41■□□□□ 0,54
Sprr1aQ62266 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,39■□□□□ 0,53
Sprr1aQ62266 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18,37■□□□□ 0,53
Sprr1aQ62266 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18,31■□□□□ 0,52
Sprr1aQ62266 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,3■□□□□ 0,52
Sprr1aQ62266 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
Sprr1aQ62266 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Sprr1aQ62266 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Sprr1aQ62266 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Sprr1aQ62266 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,22■□□□□ 0,51
Sprr1aQ62266 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,21■□□□□ 0,51
Sprr1aQ62266 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Sprr1aQ62266 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Sprr1aQ62266 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Sprr1aQ62266 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18,17■□□□□ 0,5
Sprr1aQ62266 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Sprr1aQ62266 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Sprr1aQ62266 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18,14■□□□□ 0,49
Sprr1aQ62266 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18,14■□□□□ 0,49
Sprr1aQ62266 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Sprr1aQ62266 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Sprr1aQ62266 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Sprr1aQ62266 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Sprr1aQ62266 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,03■□□□□ 0,48
Sprr1aQ62266 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Sprr1aQ62266 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Sprr1aQ62266 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18,01■□□□□ 0,47
Sprr1aQ62266 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17,99■□□□□ 0,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,3 ms