RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
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Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv3-9A0A140T8P4 119 aa6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 C530025M09RikF6RGA8 229 aa6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem86bQ497J1 226 aa6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PemtQ61907 199 aa6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prss58Q8BW11 241 aa6.96□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm20726G3UX18 150 aa6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bles03Q8VD62 251 aa6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ube2wQ8VDW4 151 aa6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krtap11-1E9Q2E9 183 aa6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 D130052B06RikQ3UW13 202 aa6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SpinklQ8CEK3 90 aa6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnah10D3YYQ8 4591 aa6.95□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnah6E9Q0B6 4144 aa6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ndufa12Q7TMF3 145 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm36176A0A1W2P8D5 158 aa6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 EnhoQ8K1D8 76 aa6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11939A2A592 99 aa6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10767Q3TQP0 103 aa6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2010109I03RikQ9CQ11 111 aa6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ighv1-56A0A0A6YXG2 117 aa6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm11213A0A1B0GR83 88 aa6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pglyrp4Q0VB07 374 aa6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Snhg11Q4G0K9 87 aa6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TeppQ6IMH0 216 aa6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PtprqP0C5E4 2300 aa6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trav13-1A0A075B644 110 aa6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnah14A0A140LIJ4 4489 aa6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wfdc17Q5SSJ1 76 aa6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 6430550D23RikE9Q1X6 194 aa6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tcl1b3P56842 122 aa6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Samd13D3YUG0 102 aa6.89□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Notch1Q01705 2531 aa6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10845Q3UNY9 185 aa6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 E130208F15RikQ3UPV3 143 aa6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4930524J08RikQ9CUJ5 163 aa6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf414Q9DCK4 299 aa6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Defb29Q8BGW9 78 aa6.88□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rps28P62858 69 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm9903Q8C9Y8 129 aa6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ighv2-9A0A075B5Q5 116 aa6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trav13-2A0A075B649 110 aa6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm5153P01627 120 aa6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tcl1b5P56845 121 aa6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm5142Q8C5X9 133 aa6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Col6a5A6H584 2640 aa6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnah17Q69Z23 4481 aa6.87□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv8-18A0A0B4J1J3 123 aa6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MifP34884 115 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv3-1A0A075B5P1 119 aa6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv1-35A0A0G2JDE5 120 aa6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm7137J3QMW1 236 aa6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CnbpP53996 178 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 5730596B20RikQ8BQ08 205 aa6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 4930556J24RikQ9D4U7 146 aa6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 VwfQ8CIZ8 2813 aa6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnah1E9Q8T7 4250 aa6.86□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AplnQ9R0R4 77 aa6.86□□□□□ -1.31
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Rabgef1-201ENSMUST00000026390 P01819 144 aa6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam19a5Q91WE9 132 aa6.85□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acyp1P56376 99 aa6.85□□□□□ -1.31
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Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv8-24A0A140T8P5 121 aa6.84□□□□□ -1.31
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 9430015G10RikA2ASP7 199 aa6.84□□□□□ -1.31
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Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnah7bL7N1Y0 4068 aa6.84□□□□□ -1.32
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm16181B0V2H2 73 aa6.83□□□□□ -1.32
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Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cox7bP56393 80 aa6.83□□□□□ -1.32
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Rabgef1-201ENSMUST00000026390 H2al1aQ5M8Q2 105 aa6.82□□□□□ -1.32
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Rabgef1-201ENSMUST00000026390 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa6.82□□□□□ -1.32
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Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10320E9PW43 113 aa6.81□□□□□ -1.32
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Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnal4Q9DCM4 105 aa6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Igkv4-92A0A0B4J1I2 117 aa6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ube2d4D3YUH6 135 aa6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AY074887Q8R5F9 132 aa6.8□□□□□ -1.32
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Defa21Q8C1P2 93 aa6.79□□□□□ -1.32
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem258P61166 79 aa6.79□□□□□ -1.32
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rpl39lQ9CQD0 51 aa6.79□□□□□ -1.32
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spata3Q9D9T6 193 aa6.79□□□□□ -1.32
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 A730009L09RikA0A1B0GS82 72 aa6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrpl55Q9CZ83 127 aa6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Reg3dQ9QUS9 175 aa6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ifitm6A0A1B0GS75 124 aa6.78□□□□□ -1.32
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10770F7D043 238 aa6.78□□□□□ -1.32
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