RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000170957.2

Ggps1-201, Transcript of Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ggps1, Length 4,244 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Igkv4-53A0A0G2JFC6 119 aa6.75□□□□□ -1.33
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 Cox7cP17665 63 aa6.74□□□□□ -1.33
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Camk2n2Q78WH7 79 aa6.74□□□□□ -1.33
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Trav13-2A0A075B649 110 aa6.74□□□□□ -1.33
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm28269A0A087WSG3 125 aa6.74□□□□□ -1.33
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 Igkv4-78A0A0A6YYE5 119 aa6.74□□□□□ -1.33
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 Trav13-1A0A075B644 110 aa6.73□□□□□ -1.33
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 2010109I03RikQ9CQ11 111 aa6.71□□□□□ -1.34
Ggps1-201ENSMUST00000170957 Igkv4-79A0A075B5L8 119 aa6.71□□□□□ -1.34
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 Plac8l1Q08EJ0 177 aa6.61□□□□□ -1.35
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 Trav3-1Q5R1I8 114 aa6.61□□□□□ -1.35
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 Gm9887F6RFI0 207 aa6.6□□□□□ -1.35
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Ggps1-201ENSMUST00000170957 3110070M22RikQ9DAQ7 118 aa6.6□□□□□ -1.35
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