Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
P01843 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
P01843 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
P01843 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,88■■□□□ 1,25
P01843 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22,63■■□□□ 1,21
P01843 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
P01843 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
P01843 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
P01843 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
P01843 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21,46■■□□□ 1,03
P01843 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
P01843 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
P01843 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
P01843 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■□□□□ 0,99
P01843 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
P01843 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
P01843 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
P01843 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
P01843 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
P01843 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
P01843 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20,83■□□□□ 0,93
P01843 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
P01843 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
P01843 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
P01843 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20,61■□□□□ 0,89
P01843 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
P01843 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
P01843 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
P01843 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
P01843 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20,33■□□□□ 0,85
P01843 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20,3■□□□□ 0,84
P01843 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
P01843 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,21■□□□□ 0,83
P01843 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,16■□□□□ 0,82
P01843 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
P01843 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
P01843 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,04■□□□□ 0,8
P01843 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,8
P01843 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,98■□□□□ 0,79
P01843 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,96■□□□□ 0,79
P01843 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC19,92■□□□□ 0,78
P01843 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
P01843 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
P01843 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
P01843 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
P01843 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
P01843 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19,84■□□□□ 0,77
P01843 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
P01843 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,77■□□□□ 0,75
P01843 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,75■□□□□ 0,75
P01843 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
P01843 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
P01843 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
P01843 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19,61■□□□□ 0,73
P01843 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
P01843 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
P01843 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19,59■□□□□ 0,73
P01843 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,56■□□□□ 0,72
P01843 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,52■□□□□ 0,71
P01843 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,51■□□□□ 0,71
P01843 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
P01843 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
P01843 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,41■□□□□ 0,7
P01843 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19,4■□□□□ 0,7
P01843 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
P01843 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19,37■□□□□ 0,69
P01843 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
P01843 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
P01843 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19,33■□□□□ 0,69
P01843 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
P01843 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
P01843 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
P01843 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
P01843 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,23■□□□□ 0,67
P01843 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
P01843 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19,2■□□□□ 0,66
P01843 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
P01843 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,18■□□□□ 0,66
P01843 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,17■□□□□ 0,66
P01843 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
P01843 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
P01843 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
P01843 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,11■□□□□ 0,65
P01843 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
P01843 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
P01843 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19,08■□□□□ 0,64
P01843 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19,07■□□□□ 0,64
P01843 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
P01843 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
P01843 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19,06■□□□□ 0,64
P01843 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
P01843 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
P01843 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
P01843 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
P01843 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
P01843 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
P01843 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
P01843 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
P01843 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
P01843 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18,88■□□□□ 0,61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms