RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AngP21570 145 aa9.19□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav3-4A0A075B654 114 aa9.19□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv3-5A0A140T8M6 119 aa9.19□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krtap24-1G3X9A2 248 aa9.19□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hcfc1Q61191 2045 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tnfrsf23Q9ER63 176 aa9.19□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spink4O35679 86 aa9.18□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acyp1P56376 99 aa9.18□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Crip3Q6Q6R3 243 aa9.18□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fgf23Q9EPC2 251 aa9.18□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm26602M0QWA4 95 aa9.17□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 P01755 137 aa9.17□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wfdc12Q9JHY3 85 aa9.17□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vps13aQ5H8C4 3166 aa9.17□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm37389A0A0A6YW05 95 aa9.17□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl39lQ9CQD0 51 aa9.16□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ly6hQ9WUC3 139 aa9.16□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defa21Q8C1P2 93 aa9.16□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cox8cA6H666 72 aa9.15□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Timm17bQ9Z0V7 172 aa9.15□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem243B2RVB9 118 aa9.15□□□□□ -0.94
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv8-5A0A0A6YY60 119 aa9.14□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ly6g6cQ9Z1Q4 126 aa9.14□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cfap54Q8C6S9 3106 aa9.14□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcl1b3P56842 122 aa9.14□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpha2Q925Q5 128 aa9.14□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam19a5Q91WE9 132 aa9.14□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Obox2E9PXV9 151 aa9.14□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv4-92A0A0B4J1I2 117 aa9.13□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf152Q8BG47 203 aa9.13□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B230307C23RikQ8BLB2 64 aa9.13□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv2-9-1A0A075B697 116 aa9.13□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Notch1Q01705 2531 aa9.13□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10401E9Q3K6 71 aa9.13□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scgb1b2O35176 93 aa9.13□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igkv4-58A0A0G2JGI6 119 aa9.12□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SycnQ8VCK7 134 aa9.12□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prrc2cQ3TLH4 2846 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9805F6YK59 57 aa9.11□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fn1P11276 2477 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tfpi2O35536 230 aa9.11□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmb11Q8BG41 302 aa9.11□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BB014433Q8C5R5 389 aa9.11□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SrarpQ3ULG3 163 aa9.1□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa9.1□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700011M02RikB1AX35 88 aa9.1□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mast4Q811L6 2618 aa9.1□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv8-13A0A075B5Y0 101 aa9.09□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ash1lQ99MY8 2958 aa9.09□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm12353A2AGJ4 60 aa9.09□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Plac8l1Q08EJ0 177 aa9.09□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stab1Q8R4Y4 2571 aa9.09□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smim1P0C8K7 78 aa9.09□□□□□ -0.95
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bod1lE9Q6J5 3032 aa9.08□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akap13E9Q394 2776 aa9.08□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AspmQ8CJ27 3122 aa9.08□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm26661M0QWV4 156 aa9.08□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbm3O89086 153 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wfdc10Q3V2J9 124 aa9.08□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ormdl1Q921I0 153 aa9.08□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm1968Q3T9I3 115 aa9.08□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Szt2A2A9C3 3431 aa9.07□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm10577Q3UDV9 132 aa9.07□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm17521F6QAC8 156 aa9.07□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CdsnQ7TPC1 561 aa9.06□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pde6gP09174 87 aa9.05□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm16485Q8C4B7 115 aa9.05□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata3Q9D9T6 193 aa9.04□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv10-1A0A0B4J1J6 119 aa9.04□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9DAQ5 155 aa9.04□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ube2d4D3YUH6 135 aa9.04□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NpwA0A1L1STR8 176 aa9.04□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defa27F2Z403 93 aa9.04□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Crip2Q9DCT8 208 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Odf3l2Q3TZ65 277 aa9.03□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trav14-1A0A0G2JF94 121 aa9.03□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc179J3QM76 67 aa9.03□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BtcQ05928 177 aa9.03□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ighv2-9A0A075B5Q5 116 aa9.02□□□□□ -0.96
Pkp1-201ENSMUST00000027667 5730596B20RikQ8BQ08 205 aa9.02□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc37aB1AWG4 3215 aa9.01□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm9195A0A140LHT4 2805 aa9.01□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klk9Q32M27 251 aa9.01□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BC025920Q3US60 128 aa9.01□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krtap26-1Q9D7N2 215 aa9.01□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcl1b5P56845 121 aa9.01□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ubr5Q80TP3 2792 aa9□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm16181B0V2H2 73 aa9□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 BikO70337 150 aa9□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A830005F24RikQ8BRT5 167 aa9□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Defb11Q8R2I7 77 aa9□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4930556J24RikQ9D4U7 146 aa8.99□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem254aP0DN89 123 aa8.99□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem254bP0DN90 123 aa8.99□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem254cP0DN91 123 aa8.99□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8K1L6 76 aa8.98□□□□□ -0.97
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Muc2Q80Z19 2680 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.1 ms