Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6J5

Bod1l, Biorientation of chromosomes in cell division protein 1-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bod1lE9Q6J5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Bod1lE9Q6J5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Bod1lE9Q6J5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Bod1lE9Q6J5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Bod1lE9Q6J5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Bod1lE9Q6J5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Bod1lE9Q6J5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Bod1lE9Q6J5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Bod1lE9Q6J5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Bod1lE9Q6J5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Bod1lE9Q6J5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Bod1lE9Q6J5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Bod1lE9Q6J5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Bod1lE9Q6J5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Bod1lE9Q6J5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Bod1lE9Q6J5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Bod1lE9Q6J5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Bod1lE9Q6J5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Bod1lE9Q6J5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Bod1lE9Q6J5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Bod1lE9Q6J5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Bod1lE9Q6J5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Bod1lE9Q6J5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Bod1lE9Q6J5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Bod1lE9Q6J5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Bod1lE9Q6J5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Bod1lE9Q6J5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Bod1lE9Q6J5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Bod1lE9Q6J5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Bod1lE9Q6J5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Bod1lE9Q6J5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Bod1lE9Q6J5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Bod1lE9Q6J5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Bod1lE9Q6J5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Bod1lE9Q6J5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bod1lE9Q6J5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Bod1lE9Q6J5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Bod1lE9Q6J5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Bod1lE9Q6J5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Bod1lE9Q6J5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bod1lE9Q6J5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Bod1lE9Q6J5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Bod1lE9Q6J5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Bod1lE9Q6J5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Bod1lE9Q6J5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Bod1lE9Q6J5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Bod1lE9Q6J5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Bod1lE9Q6J5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Bod1lE9Q6J5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Bod1lE9Q6J5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Bod1lE9Q6J5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Bod1lE9Q6J5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Bod1lE9Q6J5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bod1lE9Q6J5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bod1lE9Q6J5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Bod1lE9Q6J5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bod1lE9Q6J5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Bod1lE9Q6J5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bod1lE9Q6J5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Bod1lE9Q6J5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Bod1lE9Q6J5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Bod1lE9Q6J5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Bod1lE9Q6J5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Bod1lE9Q6J5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bod1lE9Q6J5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bod1lE9Q6J5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bod1lE9Q6J5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Bod1lE9Q6J5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Bod1lE9Q6J5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Bod1lE9Q6J5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Bod1lE9Q6J5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bod1lE9Q6J5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Bod1lE9Q6J5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bod1lE9Q6J5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bod1lE9Q6J5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Bod1lE9Q6J5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bod1lE9Q6J5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bod1lE9Q6J5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bod1lE9Q6J5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Bod1lE9Q6J5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Bod1lE9Q6J5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Bod1lE9Q6J5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bod1lE9Q6J5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bod1lE9Q6J5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Bod1lE9Q6J5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Bod1lE9Q6J5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Bod1lE9Q6J5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Bod1lE9Q6J5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Bod1lE9Q6J5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Bod1lE9Q6J5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Bod1lE9Q6J5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Bod1lE9Q6J5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bod1lE9Q6J5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bod1lE9Q6J5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bod1lE9Q6J5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bod1lE9Q6J5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bod1lE9Q6J5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Bod1lE9Q6J5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Bod1lE9Q6J5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bod1lE9Q6J5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms