RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prp2P05143 317 aa15,75■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hivep2Q3UHF7 2430 aa15,75■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spata25Q9DA57 226 aa15,74■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tenm3Q9WTS6 2715 aa15,74■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trav7-6A0A075B640 112 aa15,74■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ank2Q8C8R3 3898 aa15,74■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Myo9aQ8C170 2542 aa15,74■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Col7a1Q63870 2944 aa15,74■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trav4d-3A0A075B625 110 aa15,73■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP15,73■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm9922Q8C3P1 144 aa15,73■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Anapc13Q8R034 74 aa15,73■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa15,73■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defb2P82020 71 aa15,72■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 P01745 121 aa15,71■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Plac8l1Q08EJ0 177 aa15,71■□□□□ 0,11
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm26661M0QWV4 156 aa15,7■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Morn3Q8C5T4 241 aa15,7■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trav9d-3A0A075B695 113 aa15,7■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rpl35aO55142 110 aa15,7■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sostdc1Q9CQN4 206 aa15,7■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Crlf1Q9JM58 425 aa15,7■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Scgb1b24B1B0N6 92 aa15,69■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv1-62-1A0A075B5U3 116 aa15,69■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tfpi2O35536 230 aa15,69■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 1700020N15RikL7MTX3 112 aa15,68■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cdc42se2Q8BGH7 84 aa15,68■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ly6hQ9WUC3 139 aa15,68■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CirbpP60824 172 aaKnown RBP15,68■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fxyd5P97808 178 aa15,68■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 1700010B08RikQ9DAI7 102 aa15,68■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ube2wQ8VDW4 151 aa15,67■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10767Q3TQP0 103 aa15,67■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cep192E9Q4Y4 2514 aaKnown RBP15,66■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm7257D3YX25 99 aa15,65■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Smrp1Q2MH31 260 aa15,65■□□□□ 0,1
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv1-61P01749 117 aa15,64■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SpinklQ8CEK3 90 aa15,64■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MtorQ9JLN9 2549 aa15,64■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Atp5g1Q9CR84 136 aa15,63■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CrygaP04345 174 aa15,63■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trav13-4-dv7A0A075B6C2 110 aa15,62■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sh2d1aO88890 126 aa15,62■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cox6cQ9CPQ1 76 aa15,62■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Phpt1Q9DAK9 124 aa15,61■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Unc79Q0KK59 2596 aa15,61■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krtap16-1A2A5X5 502 aa15,61■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 1700011M02RikB1AX35 88 aa15,6■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cox7a1P56392 80 aa15,6■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf740Q6NZQ6 180 aa15,6■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10251J3QPM5 127 aa15,59■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cd99Q8VCN6 175 aa15,59■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr38Q9D994 303 aa15,59■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lyrm7Q9DA03 104 aa15,59■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trav9d-4A0A0G2JG37 103 aa15,59■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930546C10RikE9Q4Y3 121 aa15,58■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10772F7AIG4 85 aa15,58■□□□□ 0,09
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp9yF8VPU6 2556 aa15,58■□□□□ 0,08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ighv1-49A0A0A6YWX2 117 aa15,58■□□□□ 0,08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gpha2Q925Q5 128 aa15,57■□□□□ 0,08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930544G11RikQ9CR99 193 aa15,57■□□□□ 0,08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trav11A0A0B4J1J9 114 aa15,56■□□□□ 0,08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lst1O08843 95 aa15,56■□□□□ 0,08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Chchd7Q8K2Q5 85 aa15,56■□□□□ 0,08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 SelenowP63300 88 aa15,54■□□□□ 0,08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ppp1r32Q148A4 427 aa15,54■□□□□ 0,08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lyrm9Q3UN90 78 aa15,54■□□□□ 0,08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MrapQ9D159 127 aa15,53■□□□□ 0,08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Spry2Q9QXV8 315 aa15,52■□□□□ 0,08
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Epg5Q80TA9 2572 aa15,52■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Hspg2Q05793 3707 aaKnown RBP15,52■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Il19Q8CJ70 176 aa15,51■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ndufa3Q9CQ91 84 aa15,51■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TeppQ6IMH0 216 aa15,51■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prr13Q9CQJ5 137 aa15,51■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 9430069I07RikQ9CX21 111 aa15,51■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP15,5■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ly6c2P0CW03 131 aa15,5■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Akap13E9Q394 2776 aa15,5■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp462B1AWL2 2495 aaKnown RBP15,5■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MalO09198 153 aa15,5■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10577Q3UDV9 132 aa15,5■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CdsnQ7TPC1 561 aa15,5■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm10647E9Q8X0 124 aa15,49■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pfn2Q9JJV2 140 aa15,49■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mast4Q811L6 2618 aa15,49■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 TrrapQ80YV3 2565 aaKnown RBP15,49■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trav13d-4A0A0G2JFX3 110 aa15,49■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MobpQ9D2P8 170 aa15,49■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 GfyJ3KML8 504 aa15,48■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pglyrp4Q0VB07 374 aa15,48■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tomm7Q9D173 55 aa15,48■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Xlr5cQ9JJR2 179 aa15,48■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 P01755 137 aa15,47■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PemtQ61907 199 aa15,47■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pla2g1bQ9Z0Y2 146 aa15,47■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cops9Q3U898 57 aa15,47■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 B230359F08RikA0A0B4J1K3 109 aa15,46■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Defb50Q6TU36 73 aa15,46■□□□□ 0,07
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Igkv4-72A0A0B4J1I4 117 aa15,46■□□□□ 0,06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 54,8 ms