Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,95■■■□□ 2,87
Usp9yF8VPU6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Usp9yF8VPU6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Usp9yF8VPU6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,15■■■□□ 2,26
Usp9yF8VPU6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Usp9yF8VPU6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Usp9yF8VPU6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Usp9yF8VPU6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Usp9yF8VPU6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,28■■□□□ 1,96
Usp9yF8VPU6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Usp9yF8VPU6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Usp9yF8VPU6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Usp9yF8VPU6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Usp9yF8VPU6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Usp9yF8VPU6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Usp9yF8VPU6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Usp9yF8VPU6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Usp9yF8VPU6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Usp9yF8VPU6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,3■■□□□ 1,8
Usp9yF8VPU6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Usp9yF8VPU6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Usp9yF8VPU6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Usp9yF8VPU6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Usp9yF8VPU6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Usp9yF8VPU6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Usp9yF8VPU6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,64■■□□□ 1,7
Usp9yF8VPU6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Usp9yF8VPU6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Usp9yF8VPU6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Usp9yF8VPU6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Usp9yF8VPU6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
Usp9yF8VPU6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Usp9yF8VPU6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Usp9yF8VPU6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,06■■□□□ 1,6
Usp9yF8VPU6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Usp9yF8VPU6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Usp9yF8VPU6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Usp9yF8VPU6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Usp9yF8VPU6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Usp9yF8VPU6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Usp9yF8VPU6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Usp9yF8VPU6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
Usp9yF8VPU6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Usp9yF8VPU6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Usp9yF8VPU6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Usp9yF8VPU6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,58■■□□□ 1,52
Usp9yF8VPU6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
Usp9yF8VPU6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Usp9yF8VPU6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Usp9yF8VPU6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,34■■□□□ 1,49
Usp9yF8VPU6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Usp9yF8VPU6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,33■■□□□ 1,48
Usp9yF8VPU6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Usp9yF8VPU6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Usp9yF8VPU6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24,26■■□□□ 1,47
Usp9yF8VPU6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Usp9yF8VPU6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Usp9yF8VPU6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24,2■■□□□ 1,46
Usp9yF8VPU6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Usp9yF8VPU6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Usp9yF8VPU6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Usp9yF8VPU6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Usp9yF8VPU6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24,07■■□□□ 1,44
Usp9yF8VPU6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Usp9yF8VPU6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Usp9yF8VPU6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Usp9yF8VPU6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23,97■■□□□ 1,43
Usp9yF8VPU6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23,94■■□□□ 1,42
Usp9yF8VPU6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Usp9yF8VPU6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Usp9yF8VPU6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Usp9yF8VPU6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Usp9yF8VPU6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23,81■■□□□ 1,4
Usp9yF8VPU6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Usp9yF8VPU6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Usp9yF8VPU6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Usp9yF8VPU6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Usp9yF8VPU6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Usp9yF8VPU6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Usp9yF8VPU6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Usp9yF8VPU6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Usp9yF8VPU6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Usp9yF8VPU6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Usp9yF8VPU6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,52■■□□□ 1,36
Usp9yF8VPU6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Usp9yF8VPU6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23,48■■□□□ 1,35
Usp9yF8VPU6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Usp9yF8VPU6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Usp9yF8VPU6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Usp9yF8VPU6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Usp9yF8VPU6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Usp9yF8VPU6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Usp9yF8VPU6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23,38■■□□□ 1,33
Usp9yF8VPU6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Usp9yF8VPU6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Usp9yF8VPU6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Usp9yF8VPU6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23,33■■□□□ 1,32
Usp9yF8VPU6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Usp9yF8VPU6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Usp9yF8VPU6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms