Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Usp9yF8VPU6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Usp9yF8VPU6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Usp9yF8VPU6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp9yF8VPU6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp9yF8VPU6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp9yF8VPU6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp9yF8VPU6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp9yF8VPU6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp9yF8VPU6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp9yF8VPU6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp9yF8VPU6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp9yF8VPU6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp9yF8VPU6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp9yF8VPU6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp9yF8VPU6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp9yF8VPU6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp9yF8VPU6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp9yF8VPU6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp9yF8VPU6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Usp9yF8VPU6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Usp9yF8VPU6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Usp9yF8VPU6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Usp9yF8VPU6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Usp9yF8VPU6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Usp9yF8VPU6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Usp9yF8VPU6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Usp9yF8VPU6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp9yF8VPU6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp9yF8VPU6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp9yF8VPU6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp9yF8VPU6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp9yF8VPU6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp9yF8VPU6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp9yF8VPU6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp9yF8VPU6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp9yF8VPU6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp9yF8VPU6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp9yF8VPU6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp9yF8VPU6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Usp9yF8VPU6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Usp9yF8VPU6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Usp9yF8VPU6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp9yF8VPU6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp9yF8VPU6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp9yF8VPU6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp9yF8VPU6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp9yF8VPU6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp9yF8VPU6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp9yF8VPU6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp9yF8VPU6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp9yF8VPU6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp9yF8VPU6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp9yF8VPU6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp9yF8VPU6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp9yF8VPU6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp9yF8VPU6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp9yF8VPU6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp9yF8VPU6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp9yF8VPU6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp9yF8VPU6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp9yF8VPU6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp9yF8VPU6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp9yF8VPU6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp9yF8VPU6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp9yF8VPU6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp9yF8VPU6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp9yF8VPU6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp9yF8VPU6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp9yF8VPU6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp9yF8VPU6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp9yF8VPU6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp9yF8VPU6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp9yF8VPU6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp9yF8VPU6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp9yF8VPU6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp9yF8VPU6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp9yF8VPU6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp9yF8VPU6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp9yF8VPU6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp9yF8VPU6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp9yF8VPU6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp9yF8VPU6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp9yF8VPU6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp9yF8VPU6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp9yF8VPU6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp9yF8VPU6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp9yF8VPU6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp9yF8VPU6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp9yF8VPU6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp9yF8VPU6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp9yF8VPU6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Usp9yF8VPU6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp9yF8VPU6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp9yF8VPU6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp9yF8VPU6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp9yF8VPU6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Usp9yF8VPU6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp9yF8VPU6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp9yF8VPU6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms