RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CirbpP60824 172 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klk11Q9QYN3 276 aa7.25□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ly6hQ9WUC3 139 aa7.25□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Igf1P05017 153 aa7.25□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trav13d-1A0A075B606 110 aa7.24□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3618D3Z4P5 127 aa7.24□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MalO09198 153 aa7.24□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm2916Q9D9B9 127 aa7.24□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trank1Q8BV79 2999 aa7.24□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trav11A0A0B4J1J9 114 aa7.24□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AngP21570 145 aa7.24□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bri3P28662 125 aa7.24□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pgpep1lQ9CWB5 130 aa7.24□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mrpl52Q9D0Y8 121 aa7.24□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndufs7Q9DC70 224 aa7.23□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HampQ9EQ21 83 aa7.23□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lce6aD3YV94 81 aa7.23□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Xcl1P47993 114 aa7.23□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cops9Q3U898 57 aa7.23□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf740Q6NZQ6 180 aa7.23□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 5730596B20RikQ8BQ08 205 aa7.23□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01753 117 aa7.23□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm11020F6ZGD5 61 aa7.22□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa7.22□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cox17P56394 63 aa7.22□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fgfbp3Q1HCM0 245 aa7.22□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spag11Q8K4N2 71 aa7.22□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 3110018I06RikQ9CXS0 120 aa7.22□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10509O88255 85 aa7.22□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ep300B2RWS6 2412 aa7.22□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trdv5A0A075B661 115 aa7.22□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4930546C10RikE9Q4Y3 121 aa7.22□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sostdc1Q9CQN4 206 aa7.22□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfhx3Q61329 3726 aa7.22□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lmo4P61969 165 aa7.21□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Usmg5Q78IK2 58 aa7.21□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ptprz1B9EKR1 2312 aa7.21□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arid1bE9Q4N7 2244 aa7.21□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10490F6VBM2 120 aa7.21□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10577Q3UDV9 132 aa7.21□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wfdc15aQ8BH89 80 aa7.21□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Snrpd3P62320 126 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fxyd5P97808 178 aa7.21□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 D130052B06RikQ3UW13 202 aa7.21□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PemtQ61907 199 aa7.21□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4930519P11RikQ9CUJ8 166 aa7.21□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smlr1J3QMJ4 66 aa7.2□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01823 113 aa7.2□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CdsnQ7TPC1 561 aa7.2□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Igkv4-78A0A0A6YYE5 119 aa7.19□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm20726G3UX18 150 aa7.19□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lst1O08843 95 aa7.19□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sprr3O09116 238 aa7.19□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SelenowP63300 88 aa7.19□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa7.19□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Defa4P28311 92 aa7.19□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acyp1P56376 99 aa7.19□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10549Q3URY4 149 aa7.19□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ntn5Q3UQ22 452 aa7.18□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa7.18□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem258P61166 79 aa7.18□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cmya5Q70KF4 3739 aa7.18□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa7.18□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv5-8A0A075B676 92 aa7.18□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 B230217C12RikE9Q3Z1 139 aa7.18□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dand5Q76LW6 185 aa7.18□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spink12Q9D256 87 aa7.18□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv1-62-1A0A075B5U3 116 aa7.17□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Edn2P22389 175 aa7.17□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lage3Q9CR70 148 aa7.17□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm9925F6T2U3 160 aa7.17□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cox6b1P56391 86 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4930524J08RikQ9CUJ5 163 aa7.17□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Igkv4-68A0A0B4J1I7 117 aa7.17□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cela2aP05208 271 aa7.17□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ubtd1Q91WB7 227 aa7.17□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm19935A0A1B0GSF9 52 aa7.16□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Samd13D3YUG0 102 aa7.16□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10226O88253 85 aa7.16□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf152Q8BG47 203 aa7.16□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 BlcapP62951 87 aa7.16□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmo1Q5SXG7 201 aa7.16□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serp2Q6TAW2 65 aa7.16□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trav13n-1A0A0G2JEU8 110 aa7.15□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MsmbO08540 113 aa7.15□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sh2d1aO88890 126 aa7.15□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Shisa2Q8QZV2 295 aa7.15□□□□□ -1.26
Nedd1-201ENSMUST00000020163 1700011M02RikB1AX35 88 aa7.15□□□□□ -1.27
Nedd1-201ENSMUST00000020163 1810032O08RikE9PZV8 113 aa7.15□□□□□ -1.27
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Synj2bpQ9D6K5 145 aa7.15□□□□□ -1.27
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnal4Q9DCM4 105 aa7.15□□□□□ -1.27
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fbn2Q61555 2907 aa7.15□□□□□ -1.27
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pkd1l2Q7TN88 2461 aa7.15□□□□□ -1.27
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dmbt1Q60997 2085 aa7.15□□□□□ -1.27
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv2-7A0A075B5Q8 116 aa7.14□□□□□ -1.27
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tm2d2Q8R0I4 213 aa7.14□□□□□ -1.27
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10553J3QPF1 123 aa7.14□□□□□ -1.27
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tln1P26039 2541 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.9 ms