RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ighv2-6-8A0A0A6YWY9 116 aa19.01■□□□□ 0.63
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cox17P56394 63 aa19.01■□□□□ 0.63
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trav7d-3Q5R1I1 112 aa19.01■□□□□ 0.63
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tac4Q99N14 128 aa19■□□□□ 0.63
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 3110070M22RikQ9DAQ7 118 aa19■□□□□ 0.63
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Col7a1Q63870 2944 aa19■□□□□ 0.63
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Igfn1Q3KNY0 2849 aa18.99■□□□□ 0.63
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fgfbp3Q1HCM0 245 aa18.98■□□□□ 0.63
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ifitm10Q8BR26 201 aa18.98■□□□□ 0.63
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm933J3QPC1 141 aa18.97■□□□□ 0.63
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wnk1P83741 2377 aa18.96■□□□□ 0.63
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa18.96■□□□□ 0.63
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Il1f10Q8R459 152 aa18.96■□□□□ 0.63
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Unc79Q0KK59 2596 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Defb2P82020 71 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Morn5Q9DAI9 170 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Igkv4-78A0A0A6YYE5 119 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spata25Q9DA57 226 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ank2Q8C8R3 3898 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 LbhQ9CX60 105 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tenm3Q9WTS6 2715 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm9513B3GLJ6 99 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sigmar1O55242 223 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 March3Q8BRX9 218 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dmbt1Q60997 2085 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trdv5A0A075B661 115 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ighv1-11A0A0A6YWI9 117 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 NpwA0A1L1STR8 176 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm7849D3YX03 116 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Insl3O09107 122 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zc2hc1bQ9D534 172 aa18.92■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Defb26Q30KN7 186 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm20730A0A075B5J6 119 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem238A9JSM3 176 aa18.91■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm7075D3Z497 112 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rbmy1bQ60990 380 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trav13d-1A0A075B606 110 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rmi2Q3UPE3 149 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rnf152Q8BG47 203 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 MtorQ9JLN9 2549 aa18.9■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa18.89■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm45785A0A1B0GT05 94 aa18.89■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PrlhG3UWC3 86 aa18.89■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Phlda3Q9WV95 125 aa18.89■□□□□ 0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Q99M08 65 aa18.89■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Myo9aQ8C170 2542 aa18.89■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm9887F6RFI0 207 aa18.88■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 P84751 237 aa18.88■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rpl13aP19253 203 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Helz2E9QAM5 2947 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm9747Q810H1 104 aa18.87■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10300Q8C8P7 189 aa18.87■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lypd5Q9D7Z7 256 aa18.86■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm28269A0A087WSG3 125 aa18.86■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm26661M0QWV4 156 aa18.86■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Crip2Q9DCT8 208 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hivep2Q3UHF7 2430 aa18.85■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fgf23Q9EPC2 251 aa18.84■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ighv1-72P01751 139 aa18.84■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 TrrapQ80YV3 2565 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Defb47Q30KN1 79 aa18.83■□□□□ 0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ly6gP35461 111 aa18.83■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Defb42Q8BVB5 75 aa18.83■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10322F7D7I4 111 aa18.82■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cd164l2Q9D6W7 172 aa18.81■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cox8cA6H666 72 aa18.81■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Usp9yF8VPU6 2556 aa18.8■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm17472A0A075B683 117 aa18.8■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gatd1Q8BFQ8 220 aa18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp6v0e2Q91XE7 81 aa18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trav3-1Q5R1I8 114 aa18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mast4Q811L6 2618 aa18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10135F6TEE5 83 aa18.78■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rpl32-psP17932 135 aa18.78■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm9922Q8C3P1 144 aa18.78■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm6793B2RXM2 351 aa18.77■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10542F6XDR3 90 aa18.77■□□□□ 0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nop10Q9CQS2 64 aa18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spink1P09036 80 aa18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Epg5Q80TA9 2572 aa18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tmem101Q91VP7 257 aa18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 P01729 129 aa18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif4ebp1Q60876 117 aa18.73■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tnfrsf23Q9ER63 176 aa18.73■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11444F6QMA6 170 aa18.73■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa18.73■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rpl35aO55142 110 aa18.72■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rpl36aP83882 106 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm9936Q8C864 160 aa18.72■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Igkv4-79A0A075B5L8 119 aa18.72■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2310009B15RikA0A0A6YWI4 143 aa18.72■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp462B1AWL2 2495 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fxyd5P97808 178 aa18.71■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdip1Q9DB75 208 aa18.71■□□□□ 0.59
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cd99Q8VCN6 175 aa18.7■□□□□ 0.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prelid3aQ8VE85 172 aa18.7■□□□□ 0.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Glrp1E9Q9S8 174 aa18.7■□□□□ 0.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa18.7■□□□□ 0.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cep192E9Q4Y4 2514 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 P01823 113 aa18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 197.9 ms