RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089245.6

Shq1-201, Transcript of Protein SHQ1 homolog, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Shq1, Length 1,638 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm11733Q8BQP1 125 aa13□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm16223Q8CBM3 117 aa13□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm43218A0A0G2JGT0 114 aa12.99□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rnf212F6TQD1 307 aa12.99□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 LalbaP29752 143 aa12.99□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 SstP60041 116 aa12.99□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sdhaf1Q3U276 118 aa12.99□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ormdl3Q9CPZ6 153 aa12.99□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Card19Q9D1I2 183 aa12.99□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 MNCb-2875Q9DCB3 74 aa12.99□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Mmp23O88676 391 aa12.98□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 P01736 120 aa12.98□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Klk5Q9D140 293 aa12.98□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Trav14-3A0A075B607 120 aa12.97□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm9513B3GLJ6 99 aa12.97□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tomm7Q9D173 55 aa12.97□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ighv2-6A0A075B6A7 116 aa12.96□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Esp3J3QN49 87 aa12.96□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 March3Q8BRX9 218 aa12.96□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lhfpl3Q9CTN8 222 aa12.96□□□□□ -0.33
Shq1-201ENSMUST00000089245 Nat8b-psE0CYC6 232 aa12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm17430F6RSK3 157 aa12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Igkv1-99F6XWB2 120 aa12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm10772F7AIG4 85 aa12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Nat8f4G5E8L3 226 aa12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 U90926O08546 118 aa12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 NpsP0C0P8 89 aa12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sumo2P61957 95 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ndufa4Q62425 82 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm17472A0A075B683 117 aa12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm20517G3UVU6 152 aa12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 OdaphJ3QNT8 126 aa12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cbln2Q8BGU2 224 aa12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Snai3Q9QY31 287 aa12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Slc25a20Q9Z2Z6 301 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tcrg-C1A0A075B5Z0 172 aa12.94□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Defa35E9QLQ1 93 aa12.94□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tcrg-C3L7N479 172 aa12.94□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 TtrP07309 147 aa12.94□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 PolP10400 120 aa12.94□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Q3UUX7 111 aa12.94□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Smim7Q5RKS2 75 aa12.94□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm9944Q8C559 102 aa12.94□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tmem239Q9DA47 151 aa12.94□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 E130208F15RikQ3UPV3 143 aa12.93□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 PdpnQ62011 172 aa12.93□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Polr2kQ63871 58 aa12.93□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm4861Q8C5A4 106 aa12.93□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 SriQ6P069 198 aa12.91□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Pttg1Q9CQJ7 199 aa12.91□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Olfr869E9PX82 323 aa12.91□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm12169F2Z474 250 aa12.91□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tex48Q9DA81 110 aa12.91□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cst10Q9JM84 148 aa12.91□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm45623A0A1B0GSF6 103 aa12.9□□□□□ -0.34
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dnah9B1AR51 4484 aa12.89□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Vps13dB1ART2 4390 aa12.89□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm20379A0A087WR34 119 aa12.89□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ceacam15A0A0B4J1L0 234 aa12.89□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Shisal1Q0VBP7 198 aa12.89□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 PemtQ61907 199 aa12.89□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Q8CF25 301 aa12.89□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Igkv3-1A0A075B5P1 119 aa12.88□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Igkv3-9A0A140T8P4 119 aa12.88□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm28044L7N1X0 119 aa12.88□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Map1lc3aQ91VR7 121 aa12.88□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 HilpdaQ9JLS0 64 aa12.88□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Trav16d-dv11A0A075B617 117 aa12.88□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ighv1-11A0A0A6YWI9 117 aa12.88□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm28374F6SG70 93 aa12.88□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Tm2d2Q8R0I4 213 aa12.88□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 EsdQ9R0P3 282 aa12.88□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Zfp930A0A1D5RM15 441 aa12.87□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Cox7a2lQ61387 111 aa12.87□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ypel4Q65Z93 127 aa12.87□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Malsu1Q9CWV0 228 aa12.87□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Ryr1E9PZQ0 5035 aa12.86□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lgals6O54891 301 aa12.86□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 CrygaP04345 174 aa12.86□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 RetnQ99P87 114 aa12.86□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rab5aQ9CQD1 215 aa12.86□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Igkv4-78A0A0A6YYE5 119 aa12.85□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Sertad4A7DTG3 377 aa12.85□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm5426J3QNM7 103 aa12.85□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rpl32P62911 135 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Krtap10-4Q08EG8 221 aa12.85□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 CebpgP53568 150 aa12.84□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Rbx1P62878 108 aa12.84□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Urm1Q9D2P4 101 aa12.84□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Scgb2a2J3KMP9 96 aa12.84□□□□□ -0.35
Shq1-201ENSMUST00000089245 Dnah11E9Q7N9 4488 aa12.83□□□□□ -0.36
Shq1-201ENSMUST00000089245 Trav12d-3A0A075B6A4 115 aa12.83□□□□□ -0.36
Shq1-201ENSMUST00000089245 Vsig4F6TUL9 280 aa12.83□□□□□ -0.36
Shq1-201ENSMUST00000089245 Olfr1262Q8VGN2 304 aa12.83□□□□□ -0.36
Shq1-201ENSMUST00000089245 Arl14eplQ3UKZ7 152 aa12.82□□□□□ -0.36
Shq1-201ENSMUST00000089245 Scgb1b11A0A087WQJ0 93 aa12.81□□□□□ -0.36
Shq1-201ENSMUST00000089245 4930596D02RikQ3V0H9 216 aa12.81□□□□□ -0.36
Shq1-201ENSMUST00000089245 Gm16485Q8C4B7 115 aa12.81□□□□□ -0.36
Shq1-201ENSMUST00000089245 Lamtor2Q9JHS3 125 aa12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 76.6 ms