Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Lhfpl3Q9CTN8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Lhfpl3Q9CTN8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Lhfpl3Q9CTN8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Lhfpl3Q9CTN8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Lhfpl3Q9CTN8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Lhfpl3Q9CTN8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Lhfpl3Q9CTN8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Lhfpl3Q9CTN8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Lhfpl3Q9CTN8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Lhfpl3Q9CTN8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Lhfpl3Q9CTN8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Lhfpl3Q9CTN8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Lhfpl3Q9CTN8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Lhfpl3Q9CTN8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24,3■■□□□ 1,48
Lhfpl3Q9CTN8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Lhfpl3Q9CTN8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Lhfpl3Q9CTN8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Lhfpl3Q9CTN8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,06■■□□□ 1,44
Lhfpl3Q9CTN8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Lhfpl3Q9CTN8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Lhfpl3Q9CTN8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Lhfpl3Q9CTN8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Lhfpl3Q9CTN8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Lhfpl3Q9CTN8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Lhfpl3Q9CTN8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Lhfpl3Q9CTN8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Lhfpl3Q9CTN8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Lhfpl3Q9CTN8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Lhfpl3Q9CTN8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Lhfpl3Q9CTN8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Lhfpl3Q9CTN8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Lhfpl3Q9CTN8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,02■■□□□ 1,28
Lhfpl3Q9CTN8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
Lhfpl3Q9CTN8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Lhfpl3Q9CTN8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,94■■□□□ 1,26
Lhfpl3Q9CTN8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Lhfpl3Q9CTN8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Lhfpl3Q9CTN8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Lhfpl3Q9CTN8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Lhfpl3Q9CTN8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Lhfpl3Q9CTN8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Lhfpl3Q9CTN8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Lhfpl3Q9CTN8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Lhfpl3Q9CTN8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,7■■□□□ 1,22
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,69■■□□□ 1,22
Lhfpl3Q9CTN8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,69■■□□□ 1,22
Lhfpl3Q9CTN8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Lhfpl3Q9CTN8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Lhfpl3Q9CTN8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Lhfpl3Q9CTN8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Lhfpl3Q9CTN8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Lhfpl3Q9CTN8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Lhfpl3Q9CTN8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Lhfpl3Q9CTN8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Lhfpl3Q9CTN8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Lhfpl3Q9CTN8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Lhfpl3Q9CTN8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Lhfpl3Q9CTN8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Lhfpl3Q9CTN8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Lhfpl3Q9CTN8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Lhfpl3Q9CTN8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Lhfpl3Q9CTN8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Lhfpl3Q9CTN8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Lhfpl3Q9CTN8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Lhfpl3Q9CTN8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Lhfpl3Q9CTN8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,16■■□□□ 1,14
Lhfpl3Q9CTN8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Lhfpl3Q9CTN8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,13■■□□□ 1,13
Lhfpl3Q9CTN8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Lhfpl3Q9CTN8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Lhfpl3Q9CTN8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Lhfpl3Q9CTN8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Lhfpl3Q9CTN8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,07■■□□□ 1,12
Lhfpl3Q9CTN8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Lhfpl3Q9CTN8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Lhfpl3Q9CTN8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Lhfpl3Q9CTN8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,01■■□□□ 1,11
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Lhfpl3Q9CTN8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Lhfpl3Q9CTN8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21,99■■□□□ 1,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,6 ms