Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rab5aQ9CQD1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab5aQ9CQD1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rab5aQ9CQD1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rab5aQ9CQD1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab5aQ9CQD1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rab5aQ9CQD1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab5aQ9CQD1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab5aQ9CQD1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab5aQ9CQD1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rab5aQ9CQD1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab5aQ9CQD1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rab5aQ9CQD1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rab5aQ9CQD1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab5aQ9CQD1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rab5aQ9CQD1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab5aQ9CQD1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab5aQ9CQD1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab5aQ9CQD1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab5aQ9CQD1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rab5aQ9CQD1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rab5aQ9CQD1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rab5aQ9CQD1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rab5aQ9CQD1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rab5aQ9CQD1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rab5aQ9CQD1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rab5aQ9CQD1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rab5aQ9CQD1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rab5aQ9CQD1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rab5aQ9CQD1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rab5aQ9CQD1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab5aQ9CQD1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab5aQ9CQD1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab5aQ9CQD1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab5aQ9CQD1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab5aQ9CQD1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab5aQ9CQD1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab5aQ9CQD1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab5aQ9CQD1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab5aQ9CQD1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab5aQ9CQD1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab5aQ9CQD1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab5aQ9CQD1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab5aQ9CQD1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab5aQ9CQD1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab5aQ9CQD1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab5aQ9CQD1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab5aQ9CQD1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab5aQ9CQD1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab5aQ9CQD1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab5aQ9CQD1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab5aQ9CQD1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab5aQ9CQD1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab5aQ9CQD1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab5aQ9CQD1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab5aQ9CQD1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rab5aQ9CQD1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab5aQ9CQD1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab5aQ9CQD1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab5aQ9CQD1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab5aQ9CQD1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab5aQ9CQD1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab5aQ9CQD1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab5aQ9CQD1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab5aQ9CQD1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab5aQ9CQD1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab5aQ9CQD1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rab5aQ9CQD1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rab5aQ9CQD1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab5aQ9CQD1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rab5aQ9CQD1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab5aQ9CQD1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rab5aQ9CQD1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rab5aQ9CQD1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rab5aQ9CQD1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab5aQ9CQD1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rab5aQ9CQD1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rab5aQ9CQD1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rab5aQ9CQD1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rab5aQ9CQD1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab5aQ9CQD1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab5aQ9CQD1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rab5aQ9CQD1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab5aQ9CQD1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rab5aQ9CQD1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rab5aQ9CQD1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab5aQ9CQD1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab5aQ9CQD1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab5aQ9CQD1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rab5aQ9CQD1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rab5aQ9CQD1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab5aQ9CQD1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab5aQ9CQD1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rab5aQ9CQD1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rab5aQ9CQD1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rab5aQ9CQD1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rab5aQ9CQD1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms