RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01750 117 aa7.37□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spint3Q3UW09 88 aa7.37□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm17334Q8C6U3 126 aa7.37□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GalmQ8K157 342 aa7.37□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ifitm1Q9D103 106 aa7.37□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10521E9PZK0 135 aa7.36□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P06329 120 aa7.36□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 E130116L18RikQ8BMV6 101 aa7.36□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sptbn1Q62261 2363 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smg1Q8BKX6 3658 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trav4-3A0A0B4J1K1 110 aa7.36□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 3110070M22RikQ9DAQ7 118 aa7.36□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Igkv4-69A0A0B4J1I6 116 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gata1P17679 413 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam19a4Q7TPG5 135 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndufb4Q9CQC7 129 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ncor2Q9WU42 2472 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sptbn4E9PX29 2561 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nsun4C4P6S0 806 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Defa26Q3L180 93 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrcol1Q3URS3 161 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ScxQ64124 207 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Usp24B1AY13 2617 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AcacaQ5SWU9 2345 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smim10l1A0A087WNQ7 89 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krtap27-1E9PX37 202 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Glrp1E9Q9S8 174 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Casp6O08738 276 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ly86O88188 162 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cd164l2Q9D6W7 172 aa7.35□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cep250Q60952 2414 aa7.34□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa7.34□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 P01726 129 aa7.34□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prss58Q8BW11 241 aa7.34□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rpl11Q9CXW4 178 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Defa1P11477 93 aa7.34□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf183Q8QZS5 190 aa7.34□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Avpi1Q9D7H4 142 aa7.34□□□□□ -1.23
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv3-8A0A075B5T0 131 aa7.34□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Defa2P28309 93 aa7.34□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tcf15Q60756 195 aa7.34□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa7.34□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atp5g1Q9CR84 136 aa7.34□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa7.33□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krtap26-1Q9D7N2 215 aa7.33□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv1-63A0A075B5X2 117 aa7.33□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Edn3P48299 214 aa7.33□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf580Q9DB38 172 aa7.33□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rmi2Q3UPE3 149 aa7.32□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ndufa11Q9D8B4 141 aa7.32□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Esm1Q9QYY7 184 aa7.32□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Taf15Q8BQ46 557 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4930432M17RikQ3V0W9 174 aa7.32□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prr3Q811B5 190 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Defa16P50714 93 aa7.31□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eif4ebp3Q80VV3 101 aa7.31□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv2-3A0A075B696 115 aa7.31□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm17455G3UW87 128 aa7.31□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spata25Q9DA57 226 aa7.31□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dopey2Q3UHQ6 2295 aa7.31□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TeppQ6IMH0 216 aa7.31□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prr9Q8BV84 116 aa7.31□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SpinklQ8CEK3 90 aa7.31□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Defa25Q5G864 92 aa7.3□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spry2Q9QXV8 315 aa7.3□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prelid3aQ8VE85 172 aa7.3□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hes7Q8BKT2 225 aa7.3□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam208bQ5DTT3 2382 aa7.29□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trav14d-3-dv8A0A075B619 120 aa7.29□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mob4Q6PEB6 225 aa7.29□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv1-72P01751 139 aa7.29□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CrygdP04342 174 aa7.29□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm20730A0A075B5J6 119 aa7.28□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10322F7D7I4 111 aa7.28□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv1-61P01749 117 aa7.28□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pglyrp4Q0VB07 374 aa7.28□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AI854703Q8BIN3 203 aa7.28□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 OdaphJ3QNT8 126 aa7.28□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm9747Q810H1 104 aa7.28□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il19Q8CJ70 176 aa7.28□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 1700010B08RikQ9DAI7 102 aa7.28□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam216aQ9DB54 251 aa7.28□□□□□ -1.24
Nedd1-201ENSMUST00000020163 A830031A19RikQ8BNT5 113 aa7.27□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fgf23Q9EPC2 251 aa7.27□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Phpt1Q9DAK9 124 aa7.27□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hectd1Q69ZR2 2618 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm17472A0A075B683 117 aa7.27□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trav6-4A0A075B6B4 115 aa7.27□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm4861Q8C5A4 106 aa7.27□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NbasE9Q411 2356 aa7.27□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm15557A6PWY0 234 aa7.26□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm9970F6ZED4 185 aa7.26□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pla2g2aP31482 146 aa7.26□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rps28P62858 69 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ighv1-11A0A0A6YWI9 117 aa7.26□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pip4p1Q3TWL2 284 aa7.26□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4930564D02RikQ9D4S4 103 aa7.26□□□□□ -1.25
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm29666A0A087WQ99 126 aa7.25□□□□□ -1.25
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