Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Fam208bQ5DTT3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Fam208bQ5DTT3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Fam208bQ5DTT3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Fam208bQ5DTT3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Fam208bQ5DTT3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Fam208bQ5DTT3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Fam208bQ5DTT3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Fam208bQ5DTT3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Fam208bQ5DTT3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Fam208bQ5DTT3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Fam208bQ5DTT3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Fam208bQ5DTT3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fam208bQ5DTT3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam208bQ5DTT3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam208bQ5DTT3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fam208bQ5DTT3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fam208bQ5DTT3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fam208bQ5DTT3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam208bQ5DTT3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Fam208bQ5DTT3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam208bQ5DTT3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam208bQ5DTT3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fam208bQ5DTT3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fam208bQ5DTT3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fam208bQ5DTT3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fam208bQ5DTT3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fam208bQ5DTT3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fam208bQ5DTT3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Fam208bQ5DTT3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam208bQ5DTT3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Fam208bQ5DTT3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fam208bQ5DTT3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Fam208bQ5DTT3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fam208bQ5DTT3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Fam208bQ5DTT3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fam208bQ5DTT3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fam208bQ5DTT3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fam208bQ5DTT3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fam208bQ5DTT3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fam208bQ5DTT3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fam208bQ5DTT3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fam208bQ5DTT3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fam208bQ5DTT3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Fam208bQ5DTT3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fam208bQ5DTT3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam208bQ5DTT3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fam208bQ5DTT3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fam208bQ5DTT3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fam208bQ5DTT3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fam208bQ5DTT3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Fam208bQ5DTT3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam208bQ5DTT3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fam208bQ5DTT3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fam208bQ5DTT3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fam208bQ5DTT3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fam208bQ5DTT3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fam208bQ5DTT3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam208bQ5DTT3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam208bQ5DTT3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam208bQ5DTT3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam208bQ5DTT3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Fam208bQ5DTT3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Fam208bQ5DTT3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Fam208bQ5DTT3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Fam208bQ5DTT3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Fam208bQ5DTT3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fam208bQ5DTT3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fam208bQ5DTT3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fam208bQ5DTT3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam208bQ5DTT3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam208bQ5DTT3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam208bQ5DTT3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam208bQ5DTT3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam208bQ5DTT3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam208bQ5DTT3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam208bQ5DTT3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Fam208bQ5DTT3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam208bQ5DTT3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Fam208bQ5DTT3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fam208bQ5DTT3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fam208bQ5DTT3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam208bQ5DTT3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam208bQ5DTT3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fam208bQ5DTT3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam208bQ5DTT3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam208bQ5DTT3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam208bQ5DTT3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam208bQ5DTT3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam208bQ5DTT3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam208bQ5DTT3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam208bQ5DTT3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam208bQ5DTT3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam208bQ5DTT3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fam208bQ5DTT3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fam208bQ5DTT3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fam208bQ5DTT3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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