RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C SSP120P39931 234 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C JHD1P40034 492 aa2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C IRC7P43623 340 aa2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C PUS4P48567 403 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C COP1P53622 1201 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C TPO3Q06451 622 aa2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C RAD34Q06665 692 aa2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YOL057WQ08225 711 aa2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C SLX4Q12098 748 aa2.2□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C KES1P35844 434 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C IMD2P38697 523 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C IMD3P50095 523 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C SST2P11972 698 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C RRP43P25359 394 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C PET309P32522 965 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C NIC96P34077 839 aa2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C FTH1P38310 465 aa2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C RRP8P38961 392 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C STL1P39932 569 aa2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YIL092WP40497 633 aa2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YIL024CP40543 189 aa2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C CIR1P42940 261 aa2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YNL058CP53947 316 aa2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YML119WQ03208 357 aa2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C NEW1Q08972 1196 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C LYS21Q12122 440 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C AIM17P23180 465 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YCR061WP25639 631 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C MAM1P40065 302 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C LAS21P40367 830 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C CIN1P40987 1014 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C NOP2P40991 618 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C GSM1P42950 618 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C ARA2Q04212 335 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C NUR1Q12066 484 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C BI2P03873 423 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C PHO3P24031 467 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C COQ3P27680 312 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C MGM1P32266 881 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C LSC1P53598 329 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C CNM67P53865 581 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C MET14Q02196 202 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YPL071CQ02864 156 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C NUP53Q03790 475 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C MRPL1Q04599 285 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C TRI1Q05024 226 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YDL242WQ07746 117 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C GET3Q12154 354 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C NYV1Q12255 253 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C HER1Q12276 1246 aa2.18□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C GAL1P04385 528 aa2.17□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C ATP4P05626 244 aa2.17□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C SES1P07284 462 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YMR124WP39523 943 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C SAW1P39735 261 aa2.17□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C SCS2P40075 244 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C MDR1P53258 950 aa2.17□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C COG2P53271 262 aa2.17□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C PSF3Q12146 194 aa2.17□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C GAL4P04386 881 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YEF3P16521 1044 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C TGL1P34163 548 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C SDS22P36047 338 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YKL133CP36066 463 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C STB5P38699 743 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C TOM71P38825 639 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C CCT4P39078 528 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C ASK10P48361 1146 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C VTC3Q02725 835 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C UBP16Q02863 499 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C SNU56Q03782 492 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C PLM2Q04383 521 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C ENT2Q05785 613 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C SRL1Q08673 210 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C HOS1Q12214 470 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C DBP10Q12389 995 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C ADH4P10127 382 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C PTP2P29461 750 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C ARO9P38840 513 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C ERV46P39727 415 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C SAP1P39955 897 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C TPM2P40414 161 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C UBP7P40453 1071 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C YIL152WP40455 235 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C LYS20P48570 428 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C TRS31Q03337 283 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C MLC2Q06580 163 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C RTC1Q08281 1341 aa2.16□□□□□ -2.06
HDA3YPR179C VAS1P07806 1104 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C PRE2P30656 287 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C ATO2P32907 282 aa2.15□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C HIS6P40545 261 aa2.15□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C POL31P46957 487 aa2.15□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C TAN1P53072 289 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C RTS3P53289 263 aa2.15□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YAT1P80235 687 aa2.15□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YPL191CQ08930 360 aa2.15□□□□□ -2.07
HDA3YPR179C YOL114CQ12322 202 aa2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 137.6 ms