RNA–Protein interactions for RNA: YOR343W-B

YOR343W-B, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YOR343W-B, Length 5,313 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR343W-BYOR343W-B YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YEL076C-AP0CX16 216 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YLR464WP0CX17 216 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B CMK1P27466 446 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B MOT2P34909 587 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B APL3P38065 1025 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B PPE1P38796 400 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B AKR1P39010 764 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YEL076CP39971 216 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B SLZ1P40167 298 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B ASG1P40467 964 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B IST3P40565 148 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B CEP3P40969 608 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B EFM6P53970 246 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B MLH3Q12083 715 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B TAD3Q9URQ3 322 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B PHO5P00635 467 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B LCB1P25045 558 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B NUP120P35729 1037 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B SPC34P36131 295 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B EXO84P38261 753 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B VHR1P40522 640 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data2.01□□□□□ -2.09not detected
YOR343W-BYOR343W-B YNL034WP53963 612 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B BSP1Q06604 576 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B GAS5Q08193 484 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B AIM39Q08223 395 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YOL057WQ08225 711 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B RDL1Q12305 139 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YJR112W-AQ3E743 109 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B MSS116P15424 664 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B FEN2P25621 512 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B NIP100P33420 868 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B GMH1P36125 273 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B RPF2P36160 344 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B MRPL7P36519 292 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YMC2P38087 329 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B FAT1P38225 669 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B PMC1P38929 1173 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YEL020CP39994 560 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B ALK1P43633 760 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YGR127WP53275 312 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YNL092WP53934 400 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YPS7Q06325 596 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B NGL1Q08213 363 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YOL114CQ12322 202 aa2.01□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B GPH1P06738 902 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B ALG7P07286 448 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YML003WP0CF16 290 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B PCK1P10963 549 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B PCT1P13259 424 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YCR007CP25354 239 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YKL100CP34248 587 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YHR202WP38887 602 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YER010CP40011 234 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B FTR1P40088 404 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B VMA13P41807 478 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B SHR5P41912 237 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B UPF3P48412 387 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B ALT2P52892 507 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B SLG1P54867 378 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B RSF1Q05043 376 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B VID22Q05934 901 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B BUG1Q12191 341 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B HOS1Q12214 470 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B CBP1P07252 654 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B SYN8P31377 255 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B GLG1P36143 616 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B ESL1P40456 1118 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B STU2P46675 888 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B CTR1P49573 406 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B MUP1P50276 574 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YAT1P80235 687 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B FCP1Q03254 732 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B BNA5Q05979 453 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B PIG1Q06216 648 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B PRS5Q12265 496 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B URA3P03962 267 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B CMP2P14747 604 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B FUB1P25659 250 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B AGP2P38090 596 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B BPL1P48445 690 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B PIL1P53252 339 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B RPN9Q04062 393 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YOL073CQ08232 322 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B GCN4P03069 281 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B OMA1P36163 345 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B VBA2P38358 474 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B PET100P38958 111 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B CCT6P39079 546 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B YDR179W-AQ03983 463 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B SSP2Q08646 371 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B SWT1Q12104 458 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B HSP42Q12329 375 aa2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B PGA3Q12746 312 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
YOR343W-BYOR343W-B SSM4P40318 1319 aa2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.7 ms